Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7F2

Rnf169, E3 ubiquitin-protein ligase RNF169, mousemouse

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf169E9Q7F2 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf169E9Q7F2 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf169E9Q7F2 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf169E9Q7F2 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf169E9Q7F2 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf169E9Q7F2 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf169E9Q7F2 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf169E9Q7F2 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf169E9Q7F2 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf169E9Q7F2 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf169E9Q7F2 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf169E9Q7F2 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf169E9Q7F2 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf169E9Q7F2 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf169E9Q7F2 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf169E9Q7F2 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf169E9Q7F2 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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Rnf169E9Q7F2 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf169E9Q7F2 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf169E9Q7F2 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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Rnf169E9Q7F2 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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Rnf169E9Q7F2 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
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Rnf169E9Q7F2 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf169E9Q7F2 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf169E9Q7F2 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf169E9Q7F2 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
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Rnf169E9Q7F2 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf169E9Q7F2 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf169E9Q7F2 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf169E9Q7F2 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf169E9Q7F2 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf169E9Q7F2 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf169E9Q7F2 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf169E9Q7F2 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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Rnf169E9Q7F2 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf169E9Q7F2 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf169E9Q7F2 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf169E9Q7F2 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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Rnf169E9Q7F2 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf169E9Q7F2 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf169E9Q7F2 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf169E9Q7F2 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf169E9Q7F2 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf169E9Q7F2 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf169E9Q7F2 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf169E9Q7F2 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf169E9Q7F2 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf169E9Q7F2 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf169E9Q7F2 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf169E9Q7F2 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf169E9Q7F2 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf169E9Q7F2 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf169E9Q7F2 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf169E9Q7F2 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf169E9Q7F2 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf169E9Q7F2 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
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