Protein–RNA interactions for Protein: E9Q548

Gm20518, Predicted gene 20518, mousemouse

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Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20518E9Q548 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm20518E9Q548 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm20518E9Q548 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm20518E9Q548 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm20518E9Q548 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm20518E9Q548 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm20518E9Q548 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm20518E9Q548 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm20518E9Q548 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm20518E9Q548 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm20518E9Q548 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm20518E9Q548 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm20518E9Q548 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm20518E9Q548 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm20518E9Q548 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm20518E9Q548 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm20518E9Q548 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm20518E9Q548 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm20518E9Q548 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm20518E9Q548 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm20518E9Q548 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm20518E9Q548 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm20518E9Q548 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm20518E9Q548 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm20518E9Q548 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm20518E9Q548 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm20518E9Q548 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm20518E9Q548 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm20518E9Q548 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm20518E9Q548 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm20518E9Q548 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm20518E9Q548 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm20518E9Q548 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm20518E9Q548 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm20518E9Q548 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm20518E9Q548 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm20518E9Q548 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm20518E9Q548 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm20518E9Q548 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm20518E9Q548 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm20518E9Q548 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm20518E9Q548 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm20518E9Q548 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm20518E9Q548 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm20518E9Q548 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm20518E9Q548 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm20518E9Q548 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm20518E9Q548 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm20518E9Q548 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm20518E9Q548 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm20518E9Q548 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm20518E9Q548 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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Gm20518E9Q548 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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Gm20518E9Q548 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm20518E9Q548 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm20518E9Q548 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm20518E9Q548 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm20518E9Q548 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm20518E9Q548 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm20518E9Q548 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm20518E9Q548 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm20518E9Q548 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm20518E9Q548 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm20518E9Q548 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm20518E9Q548 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm20518E9Q548 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm20518E9Q548 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm20518E9Q548 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm20518E9Q548 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm20518E9Q548 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm20518E9Q548 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm20518E9Q548 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm20518E9Q548 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm20518E9Q548 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm20518E9Q548 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm20518E9Q548 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm20518E9Q548 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm20518E9Q548 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm20518E9Q548 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm20518E9Q548 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm20518E9Q548 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm20518E9Q548 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm20518E9Q548 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm20518E9Q548 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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