Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4T4

Ccdc71l, Coiled-coil domain-containing 71-like, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71lE9Q4T4 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 Pcnt-201ENSMUST00000001179 9331 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 Fbxo40-201ENSMUST00000075869 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
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