Protein–RNA interactions for Protein: E9Q043

Fndc1, Fibronectin type III domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc1E9Q043 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Fndc1E9Q043 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Fndc1E9Q043 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Fndc1E9Q043 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Fndc1E9Q043 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Fndc1E9Q043 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Fndc1E9Q043 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Fndc1E9Q043 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Fndc1E9Q043 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Fndc1E9Q043 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Fndc1E9Q043 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Fndc1E9Q043 Mir1956-201ENSMUST00000157748 65 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Fndc1E9Q043 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Fndc1E9Q043 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Fndc1E9Q043 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Fndc1E9Q043 AC126799.1-201ENSMUST00000221976 246 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Fndc1E9Q043 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Fndc1E9Q043 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Fndc1E9Q043 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Fndc1E9Q043 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Fndc1E9Q043 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Fndc1E9Q043 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Fndc1E9Q043 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Fndc1E9Q043 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Fndc1E9Q043 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Fndc1E9Q043 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Fndc1E9Q043 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Fndc1E9Q043 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Fndc1E9Q043 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Fndc1E9Q043 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Fndc1E9Q043 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Fndc1E9Q043 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Fndc1E9Q043 Bri3-202ENSMUST00000110695 669 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Fndc1E9Q043 Vps25-205ENSMUST00000121331 790 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Fndc1E9Q043 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Fndc1E9Q043 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Fndc1E9Q043 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Fndc1E9Q043 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Fndc1E9Q043 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Fndc1E9Q043 Gm8894-201ENSMUST00000074642 666 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Fndc1E9Q043 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Fndc1E9Q043 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Fndc1E9Q043 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Fndc1E9Q043 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Fndc1E9Q043 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Fndc1E9Q043 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Fndc1E9Q043 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Fndc1E9Q043 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Fndc1E9Q043 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Fndc1E9Q043 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Fndc1E9Q043 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Fndc1E9Q043 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Fndc1E9Q043 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Fndc1E9Q043 Gm15996-201ENSMUST00000161925 762 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Fndc1E9Q043 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Fndc1E9Q043 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Fndc1E9Q043 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Fndc1E9Q043 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Fndc1E9Q043 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Fndc1E9Q043 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Fndc1E9Q043 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Fndc1E9Q043 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Fndc1E9Q043 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Fndc1E9Q043 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Fndc1E9Q043 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Fndc1E9Q043 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Fndc1E9Q043 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Fndc1E9Q043 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Fndc1E9Q043 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Fndc1E9Q043 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Fndc1E9Q043 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Fndc1E9Q043 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Fndc1E9Q043 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Fndc1E9Q043 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Fndc1E9Q043 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Fndc1E9Q043 Gm5621-201ENSMUST00000187303 640 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Fndc1E9Q043 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Fndc1E9Q043 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Fndc1E9Q043 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Fndc1E9Q043 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Fndc1E9Q043 Rpl10-ps3-201ENSMUST00000076364 768 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Fndc1E9Q043 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Fndc1E9Q043 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Fndc1E9Q043 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Fndc1E9Q043 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Fndc1E9Q043 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Fndc1E9Q043 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Fndc1E9Q043 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Fndc1E9Q043 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Fndc1E9Q043 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Fndc1E9Q043 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Fndc1E9Q043 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Fndc1E9Q043 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Fndc1E9Q043 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Fndc1E9Q043 Gm11354-201ENSMUST00000121974 422 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Fndc1E9Q043 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Fndc1E9Q043 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Fndc1E9Q043 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Fndc1E9Q043 AA545190-201ENSMUST00000203495 1053 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Fndc1E9Q043 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms