Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ26

Brd1, Bromodomain-containing 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd1E9PZ26 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Brd1E9PZ26 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Brd1E9PZ26 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Brd1E9PZ26 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Brd1E9PZ26 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Brd1E9PZ26 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Brd1E9PZ26 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Brd1E9PZ26 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Brd1E9PZ26 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Brd1E9PZ26 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Brd1E9PZ26 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Brd1E9PZ26 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Brd1E9PZ26 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Brd1E9PZ26 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Brd1E9PZ26 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Brd1E9PZ26 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Brd1E9PZ26 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Brd1E9PZ26 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Brd1E9PZ26 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Brd1E9PZ26 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Brd1E9PZ26 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Brd1E9PZ26 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Brd1E9PZ26 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Brd1E9PZ26 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Brd1E9PZ26 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Brd1E9PZ26 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Brd1E9PZ26 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Brd1E9PZ26 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Brd1E9PZ26 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Brd1E9PZ26 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Brd1E9PZ26 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Brd1E9PZ26 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Brd1E9PZ26 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Brd1E9PZ26 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Brd1E9PZ26 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Brd1E9PZ26 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Brd1E9PZ26 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Brd1E9PZ26 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Brd1E9PZ26 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Brd1E9PZ26 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Brd1E9PZ26 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Brd1E9PZ26 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Brd1E9PZ26 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Brd1E9PZ26 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Brd1E9PZ26 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Brd1E9PZ26 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Brd1E9PZ26 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Brd1E9PZ26 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Brd1E9PZ26 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Brd1E9PZ26 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Brd1E9PZ26 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Brd1E9PZ26 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Brd1E9PZ26 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Brd1E9PZ26 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Brd1E9PZ26 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Brd1E9PZ26 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Brd1E9PZ26 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Brd1E9PZ26 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Brd1E9PZ26 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Brd1E9PZ26 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Brd1E9PZ26 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Brd1E9PZ26 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Brd1E9PZ26 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Brd1E9PZ26 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Brd1E9PZ26 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Brd1E9PZ26 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Brd1E9PZ26 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Brd1E9PZ26 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Brd1E9PZ26 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Brd1E9PZ26 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Brd1E9PZ26 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Brd1E9PZ26 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Brd1E9PZ26 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Brd1E9PZ26 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Brd1E9PZ26 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Brd1E9PZ26 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Brd1E9PZ26 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Brd1E9PZ26 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Brd1E9PZ26 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Brd1E9PZ26 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Brd1E9PZ26 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Brd1E9PZ26 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Brd1E9PZ26 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Brd1E9PZ26 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Brd1E9PZ26 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Brd1E9PZ26 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Brd1E9PZ26 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Brd1E9PZ26 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Brd1E9PZ26 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Brd1E9PZ26 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Brd1E9PZ26 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Brd1E9PZ26 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Brd1E9PZ26 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Brd1E9PZ26 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Brd1E9PZ26 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Brd1E9PZ26 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Brd1E9PZ26 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Brd1E9PZ26 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Brd1E9PZ26 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Brd1E9PZ26 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms