Protein–RNA interactions for Protein: E9PUP1

Syde2, Synapse defective 1, Rho GTPase, homolog 2 (C. elegans), mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde2E9PUP1 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Syde2E9PUP1 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Syde2E9PUP1 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Syde2E9PUP1 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Syde2E9PUP1 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Syde2E9PUP1 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Syde2E9PUP1 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Syde2E9PUP1 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Syde2E9PUP1 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Syde2E9PUP1 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Syde2E9PUP1 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Syde2E9PUP1 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Syde2E9PUP1 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Syde2E9PUP1 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Syde2E9PUP1 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Syde2E9PUP1 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Syde2E9PUP1 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Syde2E9PUP1 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Syde2E9PUP1 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Syde2E9PUP1 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Syde2E9PUP1 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Syde2E9PUP1 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Syde2E9PUP1 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Syde2E9PUP1 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Syde2E9PUP1 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Syde2E9PUP1 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Syde2E9PUP1 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Syde2E9PUP1 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Syde2E9PUP1 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Syde2E9PUP1 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Syde2E9PUP1 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Syde2E9PUP1 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Syde2E9PUP1 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Syde2E9PUP1 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Syde2E9PUP1 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Syde2E9PUP1 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Syde2E9PUP1 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Syde2E9PUP1 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Syde2E9PUP1 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Syde2E9PUP1 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Syde2E9PUP1 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Syde2E9PUP1 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Syde2E9PUP1 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Syde2E9PUP1 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Syde2E9PUP1 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Syde2E9PUP1 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Syde2E9PUP1 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Syde2E9PUP1 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Syde2E9PUP1 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Syde2E9PUP1 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Syde2E9PUP1 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Syde2E9PUP1 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Syde2E9PUP1 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Syde2E9PUP1 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Syde2E9PUP1 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Syde2E9PUP1 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Syde2E9PUP1 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Syde2E9PUP1 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Syde2E9PUP1 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Syde2E9PUP1 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Syde2E9PUP1 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Syde2E9PUP1 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Syde2E9PUP1 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Syde2E9PUP1 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Syde2E9PUP1 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Syde2E9PUP1 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Syde2E9PUP1 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Syde2E9PUP1 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Syde2E9PUP1 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Syde2E9PUP1 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Syde2E9PUP1 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Syde2E9PUP1 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Syde2E9PUP1 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Syde2E9PUP1 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Syde2E9PUP1 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Syde2E9PUP1 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Syde2E9PUP1 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Syde2E9PUP1 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Syde2E9PUP1 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Syde2E9PUP1 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Syde2E9PUP1 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Syde2E9PUP1 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Syde2E9PUP1 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Syde2E9PUP1 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Syde2E9PUP1 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Syde2E9PUP1 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Syde2E9PUP1 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Syde2E9PUP1 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Syde2E9PUP1 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Syde2E9PUP1 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Syde2E9PUP1 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Syde2E9PUP1 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Syde2E9PUP1 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Syde2E9PUP1 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Syde2E9PUP1 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Syde2E9PUP1 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Syde2E9PUP1 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Syde2E9PUP1 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Syde2E9PUP1 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Syde2E9PUP1 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms