Protein–RNA interactions for Protein: D3Z3K2

Ccnb1ip1, E3 ubiquitin-protein ligase CCNB1IP1, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnb1ip1D3Z3K2 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccnb1ip1D3Z3K2 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccnb1ip1D3Z3K2 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccnb1ip1D3Z3K2 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccnb1ip1D3Z3K2 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccnb1ip1D3Z3K2 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccnb1ip1D3Z3K2 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccnb1ip1D3Z3K2 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccnb1ip1D3Z3K2 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccnb1ip1D3Z3K2 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccnb1ip1D3Z3K2 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccnb1ip1D3Z3K2 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccnb1ip1D3Z3K2 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccnb1ip1D3Z3K2 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccnb1ip1D3Z3K2 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccnb1ip1D3Z3K2 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccnb1ip1D3Z3K2 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccnb1ip1D3Z3K2 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccnb1ip1D3Z3K2 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccnb1ip1D3Z3K2 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccnb1ip1D3Z3K2 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccnb1ip1D3Z3K2 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccnb1ip1D3Z3K2 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccnb1ip1D3Z3K2 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccnb1ip1D3Z3K2 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccnb1ip1D3Z3K2 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccnb1ip1D3Z3K2 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccnb1ip1D3Z3K2 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccnb1ip1D3Z3K2 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccnb1ip1D3Z3K2 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccnb1ip1D3Z3K2 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccnb1ip1D3Z3K2 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccnb1ip1D3Z3K2 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccnb1ip1D3Z3K2 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccnb1ip1D3Z3K2 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccnb1ip1D3Z3K2 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccnb1ip1D3Z3K2 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccnb1ip1D3Z3K2 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccnb1ip1D3Z3K2 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccnb1ip1D3Z3K2 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccnb1ip1D3Z3K2 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccnb1ip1D3Z3K2 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ccnb1ip1D3Z3K2 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ccnb1ip1D3Z3K2 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ccnb1ip1D3Z3K2 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ccnb1ip1D3Z3K2 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ccnb1ip1D3Z3K2 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Ccnb1ip1D3Z3K2 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ccnb1ip1D3Z3K2 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ccnb1ip1D3Z3K2 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ccnb1ip1D3Z3K2 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Ccnb1ip1D3Z3K2 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms