Protein–RNA interactions for Protein: D3YZP9

Ccdc6, Coiled-coil domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc6D3YZP9 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc6D3YZP9 Gm8894-201ENSMUST00000074642 666 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc6D3YZP9 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc6D3YZP9 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc6D3YZP9 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc6D3YZP9 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc6D3YZP9 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc6D3YZP9 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc6D3YZP9 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc6D3YZP9 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc6D3YZP9 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc6D3YZP9 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc6D3YZP9 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc6D3YZP9 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc6D3YZP9 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc6D3YZP9 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc6D3YZP9 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc6D3YZP9 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc6D3YZP9 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc6D3YZP9 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc6D3YZP9 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc6D3YZP9 Diablo-210ENSMUST00000200247 748 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc6D3YZP9 Prrxl1-205ENSMUST00000228878 723 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc6D3YZP9 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc6D3YZP9 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc6D3YZP9 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc6D3YZP9 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc6D3YZP9 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc6D3YZP9 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc6D3YZP9 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc6D3YZP9 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc6D3YZP9 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc6D3YZP9 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc6D3YZP9 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc6D3YZP9 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc6D3YZP9 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc6D3YZP9 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc6D3YZP9 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc6D3YZP9 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc6D3YZP9 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc6D3YZP9 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc6D3YZP9 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc6D3YZP9 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc6D3YZP9 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc6D3YZP9 Gm11801-201ENSMUST00000117807 746 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc6D3YZP9 Gm13600-201ENSMUST00000117949 744 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc6D3YZP9 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc6D3YZP9 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc6D3YZP9 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc6D3YZP9 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc6D3YZP9 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc6D3YZP9 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc6D3YZP9 Gm9463-201ENSMUST00000206707 601 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc6D3YZP9 Gm31401-201ENSMUST00000207352 734 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc6D3YZP9 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc6D3YZP9 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc6D3YZP9 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc6D3YZP9 Rpl3l-201ENSMUST00000045186 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc6D3YZP9 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc6D3YZP9 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc6D3YZP9 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc6D3YZP9 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc6D3YZP9 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc6D3YZP9 Ccdc42os-201ENSMUST00000148019 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc6D3YZP9 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc6D3YZP9 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc6D3YZP9 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc6D3YZP9 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc6D3YZP9 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc6D3YZP9 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc6D3YZP9 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc6D3YZP9 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc6D3YZP9 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc6D3YZP9 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc6D3YZP9 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc6D3YZP9 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc6D3YZP9 E130307A14Rik-203ENSMUST00000136862 608 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc6D3YZP9 Gm13609-201ENSMUST00000141023 589 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc6D3YZP9 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc6D3YZP9 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc6D3YZP9 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc6D3YZP9 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc6D3YZP9 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc6D3YZP9 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc6D3YZP9 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc6D3YZP9 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc6D3YZP9 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc6D3YZP9 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc6D3YZP9 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc6D3YZP9 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc6D3YZP9 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc6D3YZP9 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc6D3YZP9 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc6D3YZP9 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc6D3YZP9 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc6D3YZP9 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc6D3YZP9 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc6D3YZP9 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Ccdc6D3YZP9 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc6D3YZP9 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 340.6 ms