Protein–RNA interactions for Protein: D3YVI9

Trim30c, Tripartite motif-containing 30C, mousemouse

Predictions only

Length 513 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim30cD3YVI9 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim30cD3YVI9 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim30cD3YVI9 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim30cD3YVI9 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim30cD3YVI9 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim30cD3YVI9 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim30cD3YVI9 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim30cD3YVI9 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim30cD3YVI9 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim30cD3YVI9 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim30cD3YVI9 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim30cD3YVI9 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim30cD3YVI9 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim30cD3YVI9 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim30cD3YVI9 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim30cD3YVI9 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim30cD3YVI9 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim30cD3YVI9 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim30cD3YVI9 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim30cD3YVI9 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim30cD3YVI9 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim30cD3YVI9 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim30cD3YVI9 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim30cD3YVI9 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim30cD3YVI9 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim30cD3YVI9 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim30cD3YVI9 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim30cD3YVI9 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim30cD3YVI9 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim30cD3YVI9 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim30cD3YVI9 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim30cD3YVI9 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim30cD3YVI9 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim30cD3YVI9 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim30cD3YVI9 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim30cD3YVI9 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim30cD3YVI9 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim30cD3YVI9 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim30cD3YVI9 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim30cD3YVI9 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim30cD3YVI9 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim30cD3YVI9 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim30cD3YVI9 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim30cD3YVI9 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim30cD3YVI9 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim30cD3YVI9 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim30cD3YVI9 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim30cD3YVI9 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim30cD3YVI9 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim30cD3YVI9 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim30cD3YVI9 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim30cD3YVI9 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim30cD3YVI9 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim30cD3YVI9 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim30cD3YVI9 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim30cD3YVI9 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim30cD3YVI9 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim30cD3YVI9 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim30cD3YVI9 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim30cD3YVI9 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim30cD3YVI9 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim30cD3YVI9 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim30cD3YVI9 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim30cD3YVI9 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim30cD3YVI9 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim30cD3YVI9 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim30cD3YVI9 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim30cD3YVI9 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim30cD3YVI9 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim30cD3YVI9 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim30cD3YVI9 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim30cD3YVI9 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim30cD3YVI9 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim30cD3YVI9 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim30cD3YVI9 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim30cD3YVI9 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim30cD3YVI9 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim30cD3YVI9 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim30cD3YVI9 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim30cD3YVI9 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim30cD3YVI9 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim30cD3YVI9 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim30cD3YVI9 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim30cD3YVI9 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim30cD3YVI9 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim30cD3YVI9 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim30cD3YVI9 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim30cD3YVI9 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim30cD3YVI9 Gm28196-201ENSMUST00000187719 640 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim30cD3YVI9 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim30cD3YVI9 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim30cD3YVI9 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim30cD3YVI9 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim30cD3YVI9 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim30cD3YVI9 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim30cD3YVI9 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim30cD3YVI9 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim30cD3YVI9 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim30cD3YVI9 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim30cD3YVI9 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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