Protein–RNA interactions for Protein: B9EKI3

Tmf1, TATA element modulatory factor, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmf1B9EKI3 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmf1B9EKI3 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmf1B9EKI3 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmf1B9EKI3 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmf1B9EKI3 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmf1B9EKI3 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmf1B9EKI3 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmf1B9EKI3 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmf1B9EKI3 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmf1B9EKI3 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmf1B9EKI3 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmf1B9EKI3 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmf1B9EKI3 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmf1B9EKI3 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmf1B9EKI3 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmf1B9EKI3 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmf1B9EKI3 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmf1B9EKI3 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmf1B9EKI3 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmf1B9EKI3 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmf1B9EKI3 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmf1B9EKI3 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmf1B9EKI3 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmf1B9EKI3 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmf1B9EKI3 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmf1B9EKI3 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmf1B9EKI3 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmf1B9EKI3 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmf1B9EKI3 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmf1B9EKI3 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmf1B9EKI3 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmf1B9EKI3 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmf1B9EKI3 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmf1B9EKI3 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmf1B9EKI3 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmf1B9EKI3 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmf1B9EKI3 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmf1B9EKI3 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmf1B9EKI3 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmf1B9EKI3 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmf1B9EKI3 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmf1B9EKI3 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmf1B9EKI3 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmf1B9EKI3 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmf1B9EKI3 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmf1B9EKI3 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmf1B9EKI3 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmf1B9EKI3 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmf1B9EKI3 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmf1B9EKI3 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmf1B9EKI3 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmf1B9EKI3 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmf1B9EKI3 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmf1B9EKI3 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmf1B9EKI3 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmf1B9EKI3 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmf1B9EKI3 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmf1B9EKI3 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmf1B9EKI3 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmf1B9EKI3 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmf1B9EKI3 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmf1B9EKI3 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmf1B9EKI3 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmf1B9EKI3 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmf1B9EKI3 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmf1B9EKI3 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmf1B9EKI3 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmf1B9EKI3 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmf1B9EKI3 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmf1B9EKI3 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmf1B9EKI3 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmf1B9EKI3 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmf1B9EKI3 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmf1B9EKI3 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmf1B9EKI3 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmf1B9EKI3 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmf1B9EKI3 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmf1B9EKI3 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmf1B9EKI3 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmf1B9EKI3 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmf1B9EKI3 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmf1B9EKI3 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmf1B9EKI3 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmf1B9EKI3 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmf1B9EKI3 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmf1B9EKI3 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmf1B9EKI3 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmf1B9EKI3 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmf1B9EKI3 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmf1B9EKI3 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmf1B9EKI3 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmf1B9EKI3 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmf1B9EKI3 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmf1B9EKI3 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmf1B9EKI3 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmf1B9EKI3 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmf1B9EKI3 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmf1B9EKI3 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmf1B9EKI3 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmf1B9EKI3 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.8 ms