Protein–RNA interactions for Protein: B2RUS7

Abcc8, ATP-binding cassette, sub-family C (CFTR/MRP), member 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc8B2RUS7 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Abcc8B2RUS7 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Abcc8B2RUS7 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Abcc8B2RUS7 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Abcc8B2RUS7 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Abcc8B2RUS7 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Abcc8B2RUS7 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Abcc8B2RUS7 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Abcc8B2RUS7 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Abcc8B2RUS7 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Abcc8B2RUS7 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Abcc8B2RUS7 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Abcc8B2RUS7 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Abcc8B2RUS7 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Abcc8B2RUS7 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Abcc8B2RUS7 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Abcc8B2RUS7 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Abcc8B2RUS7 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Abcc8B2RUS7 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Abcc8B2RUS7 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Abcc8B2RUS7 Bbs5-202ENSMUST00000112286 1397 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Abcc8B2RUS7 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Abcc8B2RUS7 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Abcc8B2RUS7 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Abcc8B2RUS7 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Abcc8B2RUS7 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Abcc8B2RUS7 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Abcc8B2RUS7 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Abcc8B2RUS7 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Abcc8B2RUS7 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Abcc8B2RUS7 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Abcc8B2RUS7 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Abcc8B2RUS7 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Abcc8B2RUS7 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Abcc8B2RUS7 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Abcc8B2RUS7 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Abcc8B2RUS7 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Abcc8B2RUS7 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Abcc8B2RUS7 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Abcc8B2RUS7 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Abcc8B2RUS7 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Abcc8B2RUS7 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Abcc8B2RUS7 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
Abcc8B2RUS7 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Abcc8B2RUS7 Trpm2-201ENSMUST00000105399 731 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Abcc8B2RUS7 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Abcc8B2RUS7 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Abcc8B2RUS7 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Abcc8B2RUS7 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Abcc8B2RUS7 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Abcc8B2RUS7 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Abcc8B2RUS7 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Abcc8B2RUS7 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Abcc8B2RUS7 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Abcc8B2RUS7 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Abcc8B2RUS7 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Abcc8B2RUS7 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Abcc8B2RUS7 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Abcc8B2RUS7 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Abcc8B2RUS7 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Abcc8B2RUS7 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Abcc8B2RUS7 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Abcc8B2RUS7 Gm12798-201ENSMUST00000124786 666 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Abcc8B2RUS7 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Abcc8B2RUS7 Gm11211-201ENSMUST00000143618 359 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
Abcc8B2RUS7 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Abcc8B2RUS7 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Abcc8B2RUS7 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Abcc8B2RUS7 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Abcc8B2RUS7 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Abcc8B2RUS7 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Abcc8B2RUS7 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
Abcc8B2RUS7 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Abcc8B2RUS7 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Abcc8B2RUS7 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Abcc8B2RUS7 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Abcc8B2RUS7 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Abcc8B2RUS7 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Abcc8B2RUS7 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Abcc8B2RUS7 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Abcc8B2RUS7 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Abcc8B2RUS7 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Abcc8B2RUS7 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Abcc8B2RUS7 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Abcc8B2RUS7 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Abcc8B2RUS7 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Abcc8B2RUS7 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Abcc8B2RUS7 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Abcc8B2RUS7 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Abcc8B2RUS7 Ccdc163-204ENSMUST00000106464 1213 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Abcc8B2RUS7 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Abcc8B2RUS7 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Abcc8B2RUS7 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Abcc8B2RUS7 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Abcc8B2RUS7 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Abcc8B2RUS7 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Abcc8B2RUS7 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Abcc8B2RUS7 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Abcc8B2RUS7 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Abcc8B2RUS7 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms