Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PtprbB2RU80 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PtprbB2RU80 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PtprbB2RU80 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PtprbB2RU80 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PtprbB2RU80 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PtprbB2RU80 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PtprbB2RU80 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PtprbB2RU80 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PtprbB2RU80 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
PtprbB2RU80 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
PtprbB2RU80 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PtprbB2RU80 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
PtprbB2RU80 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PtprbB2RU80 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
PtprbB2RU80 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PtprbB2RU80 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PtprbB2RU80 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PtprbB2RU80 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PtprbB2RU80 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PtprbB2RU80 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PtprbB2RU80 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PtprbB2RU80 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PtprbB2RU80 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PtprbB2RU80 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PtprbB2RU80 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PtprbB2RU80 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
PtprbB2RU80 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
PtprbB2RU80 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
PtprbB2RU80 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PtprbB2RU80 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PtprbB2RU80 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
PtprbB2RU80 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PtprbB2RU80 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
PtprbB2RU80 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
PtprbB2RU80 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PtprbB2RU80 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
PtprbB2RU80 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
PtprbB2RU80 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
PtprbB2RU80 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
PtprbB2RU80 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PtprbB2RU80 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
PtprbB2RU80 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PtprbB2RU80 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PtprbB2RU80 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
PtprbB2RU80 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PtprbB2RU80 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PtprbB2RU80 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PtprbB2RU80 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PtprbB2RU80 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PtprbB2RU80 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PtprbB2RU80 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PtprbB2RU80 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
PtprbB2RU80 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PtprbB2RU80 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PtprbB2RU80 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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PtprbB2RU80 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
PtprbB2RU80 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
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PtprbB2RU80 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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PtprbB2RU80 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PtprbB2RU80 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PtprbB2RU80 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PtprbB2RU80 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
PtprbB2RU80 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
PtprbB2RU80 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PtprbB2RU80 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PtprbB2RU80 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
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PtprbB2RU80 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
PtprbB2RU80 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PtprbB2RU80 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PtprbB2RU80 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
PtprbB2RU80 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PtprbB2RU80 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PtprbB2RU80 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PtprbB2RU80 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
PtprbB2RU80 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PtprbB2RU80 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PtprbB2RU80 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PtprbB2RU80 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PtprbB2RU80 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
PtprbB2RU80 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PtprbB2RU80 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
PtprbB2RU80 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
PtprbB2RU80 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PtprbB2RU80 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PtprbB2RU80 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
PtprbB2RU80 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
PtprbB2RU80 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PtprbB2RU80 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
PtprbB2RU80 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PtprbB2RU80 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PtprbB2RU80 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
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