Protein–RNA interactions for Protein: B2RRF6

Znf518a, Zinc finger protein 518A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf518aB2RRF6 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Znf518aB2RRF6 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Znf518aB2RRF6 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Znf518aB2RRF6 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Znf518aB2RRF6 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Znf518aB2RRF6 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Znf518aB2RRF6 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Znf518aB2RRF6 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Znf518aB2RRF6 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Znf518aB2RRF6 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Znf518aB2RRF6 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Znf518aB2RRF6 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Znf518aB2RRF6 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Znf518aB2RRF6 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Znf518aB2RRF6 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Znf518aB2RRF6 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Znf518aB2RRF6 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Znf518aB2RRF6 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Znf518aB2RRF6 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Znf518aB2RRF6 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Znf518aB2RRF6 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Znf518aB2RRF6 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Znf518aB2RRF6 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Znf518aB2RRF6 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Znf518aB2RRF6 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Znf518aB2RRF6 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Znf518aB2RRF6 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Znf518aB2RRF6 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Znf518aB2RRF6 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Znf518aB2RRF6 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Znf518aB2RRF6 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Znf518aB2RRF6 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Znf518aB2RRF6 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Znf518aB2RRF6 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Znf518aB2RRF6 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Znf518aB2RRF6 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Znf518aB2RRF6 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Znf518aB2RRF6 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Znf518aB2RRF6 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Znf518aB2RRF6 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Znf518aB2RRF6 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Znf518aB2RRF6 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Znf518aB2RRF6 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Znf518aB2RRF6 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Znf518aB2RRF6 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Znf518aB2RRF6 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Znf518aB2RRF6 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Znf518aB2RRF6 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Znf518aB2RRF6 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Znf518aB2RRF6 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Znf518aB2RRF6 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Znf518aB2RRF6 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Znf518aB2RRF6 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Znf518aB2RRF6 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Znf518aB2RRF6 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Znf518aB2RRF6 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Znf518aB2RRF6 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Znf518aB2RRF6 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Znf518aB2RRF6 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Znf518aB2RRF6 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Znf518aB2RRF6 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Znf518aB2RRF6 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Znf518aB2RRF6 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Znf518aB2RRF6 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Znf518aB2RRF6 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Znf518aB2RRF6 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Znf518aB2RRF6 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Znf518aB2RRF6 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Znf518aB2RRF6 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Znf518aB2RRF6 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Znf518aB2RRF6 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Znf518aB2RRF6 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Znf518aB2RRF6 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Znf518aB2RRF6 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Znf518aB2RRF6 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Znf518aB2RRF6 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Znf518aB2RRF6 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Znf518aB2RRF6 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Znf518aB2RRF6 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Znf518aB2RRF6 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Znf518aB2RRF6 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Znf518aB2RRF6 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Znf518aB2RRF6 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Znf518aB2RRF6 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Znf518aB2RRF6 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Znf518aB2RRF6 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Znf518aB2RRF6 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Znf518aB2RRF6 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Znf518aB2RRF6 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Znf518aB2RRF6 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Znf518aB2RRF6 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Znf518aB2RRF6 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Znf518aB2RRF6 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Znf518aB2RRF6 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Znf518aB2RRF6 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Znf518aB2RRF6 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Znf518aB2RRF6 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Znf518aB2RRF6 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Znf518aB2RRF6 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Znf518aB2RRF6 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms