Protein–RNA interactions for Protein: B1AV60

Nhs, NHS actin-remodeling regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,647 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NhsB1AV60 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NhsB1AV60 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NhsB1AV60 Gm7535-201ENSMUST00000164167 909 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NhsB1AV60 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
NhsB1AV60 Gm40652-201ENSMUST00000218944 895 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NhsB1AV60 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
NhsB1AV60 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NhsB1AV60 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NhsB1AV60 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NhsB1AV60 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
NhsB1AV60 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NhsB1AV60 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NhsB1AV60 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NhsB1AV60 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NhsB1AV60 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NhsB1AV60 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NhsB1AV60 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NhsB1AV60 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NhsB1AV60 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NhsB1AV60 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NhsB1AV60 Tulp2-202ENSMUST00000085331 1525 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NhsB1AV60 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
NhsB1AV60 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NhsB1AV60 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
NhsB1AV60 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NhsB1AV60 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NhsB1AV60 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NhsB1AV60 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NhsB1AV60 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NhsB1AV60 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NhsB1AV60 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NhsB1AV60 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NhsB1AV60 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NhsB1AV60 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NhsB1AV60 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NhsB1AV60 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NhsB1AV60 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NhsB1AV60 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NhsB1AV60 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NhsB1AV60 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NhsB1AV60 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
NhsB1AV60 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NhsB1AV60 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NhsB1AV60 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
NhsB1AV60 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NhsB1AV60 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
NhsB1AV60 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NhsB1AV60 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NhsB1AV60 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NhsB1AV60 Ccdc42os-201ENSMUST00000148019 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NhsB1AV60 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
NhsB1AV60 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
NhsB1AV60 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
NhsB1AV60 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
NhsB1AV60 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
NhsB1AV60 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
NhsB1AV60 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
NhsB1AV60 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
NhsB1AV60 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
NhsB1AV60 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NhsB1AV60 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
NhsB1AV60 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NhsB1AV60 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NhsB1AV60 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NhsB1AV60 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NhsB1AV60 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NhsB1AV60 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NhsB1AV60 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
NhsB1AV60 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
NhsB1AV60 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NhsB1AV60 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
NhsB1AV60 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NhsB1AV60 Gm25517-201ENSMUST00000083865 134 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
NhsB1AV60 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NhsB1AV60 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
NhsB1AV60 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NhsB1AV60 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NhsB1AV60 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
NhsB1AV60 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NhsB1AV60 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NhsB1AV60 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NhsB1AV60 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NhsB1AV60 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NhsB1AV60 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NhsB1AV60 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NhsB1AV60 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NhsB1AV60 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NhsB1AV60 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NhsB1AV60 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NhsB1AV60 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NhsB1AV60 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NhsB1AV60 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NhsB1AV60 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NhsB1AV60 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NhsB1AV60 Gm12795-201ENSMUST00000117594 539 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
NhsB1AV60 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NhsB1AV60 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NhsB1AV60 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NhsB1AV60 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NhsB1AV60 Gm9463-201ENSMUST00000206707 601 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms