Protein–RNA interactions for Protein: B1ARI9

Prr29, Proline-rich protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr29B1ARI9 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prr29B1ARI9 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prr29B1ARI9 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prr29B1ARI9 Gm11622-201ENSMUST00000120525 691 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Prr29B1ARI9 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prr29B1ARI9 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prr29B1ARI9 Gm3047-202ENSMUST00000177998 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prr29B1ARI9 Gm8297-203ENSMUST00000178389 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prr29B1ARI9 Gm3460-202ENSMUST00000178927 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prr29B1ARI9 Gm21103-203ENSMUST00000179042 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prr29B1ARI9 Gm8159-203ENSMUST00000179231 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prr29B1ARI9 Gm3029-202ENSMUST00000179327 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prr29B1ARI9 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prr29B1ARI9 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prr29B1ARI9 Fam122c-203ENSMUST00000186314 898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prr29B1ARI9 Gm28514-201ENSMUST00000187488 450 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prr29B1ARI9 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prr29B1ARI9 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Prr29B1ARI9 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prr29B1ARI9 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prr29B1ARI9 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prr29B1ARI9 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prr29B1ARI9 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prr29B1ARI9 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prr29B1ARI9 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prr29B1ARI9 Mterf1b-201ENSMUST00000177258 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prr29B1ARI9 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prr29B1ARI9 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prr29B1ARI9 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prr29B1ARI9 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prr29B1ARI9 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prr29B1ARI9 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prr29B1ARI9 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prr29B1ARI9 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prr29B1ARI9 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prr29B1ARI9 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prr29B1ARI9 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prr29B1ARI9 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prr29B1ARI9 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prr29B1ARI9 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Prr29B1ARI9 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prr29B1ARI9 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prr29B1ARI9 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prr29B1ARI9 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Prr29B1ARI9 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prr29B1ARI9 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prr29B1ARI9 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prr29B1ARI9 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prr29B1ARI9 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Prr29B1ARI9 Gm14718-201ENSMUST00000138082 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prr29B1ARI9 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prr29B1ARI9 Vmn1r166-201ENSMUST00000164045 921 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prr29B1ARI9 Gm8453-201ENSMUST00000167253 921 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prr29B1ARI9 Gm4498-201ENSMUST00000168580 921 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prr29B1ARI9 Vmn1r118-201ENSMUST00000172322 921 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prr29B1ARI9 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prr29B1ARI9 Gm8693-201ENSMUST00000178871 921 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prr29B1ARI9 Vmn1r138-201ENSMUST00000179206 921 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prr29B1ARI9 Vmn1r131-201ENSMUST00000179390 921 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prr29B1ARI9 Vmn1r111-201ENSMUST00000179511 921 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prr29B1ARI9 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prr29B1ARI9 1500004A13Rik-201ENSMUST00000183374 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prr29B1ARI9 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prr29B1ARI9 Gm18348-201ENSMUST00000191227 820 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Prr29B1ARI9 9430083B18Rik-201ENSMUST00000191908 863 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Prr29B1ARI9 Gm37700-201ENSMUST00000192617 965 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Prr29B1ARI9 Gm45636-201ENSMUST00000210497 1064 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Prr29B1ARI9 Axdnd1-210ENSMUST00000212747 1238 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prr29B1ARI9 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Prr29B1ARI9 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Prr29B1ARI9 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prr29B1ARI9 Olfr1466-201ENSMUST00000075868 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prr29B1ARI9 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Prr29B1ARI9 Esp6-201ENSMUST00000097324 658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prr29B1ARI9 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prr29B1ARI9 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prr29B1ARI9 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prr29B1ARI9 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prr29B1ARI9 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prr29B1ARI9 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prr29B1ARI9 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Prr29B1ARI9 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Prr29B1ARI9 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Prr29B1ARI9 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prr29B1ARI9 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prr29B1ARI9 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prr29B1ARI9 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Prr29B1ARI9 Tmem156-201ENSMUST00000043352 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prr29B1ARI9 Prl8a6-203ENSMUST00000110355 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prr29B1ARI9 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prr29B1ARI9 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prr29B1ARI9 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prr29B1ARI9 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prr29B1ARI9 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prr29B1ARI9 Gm28724-201ENSMUST00000186149 625 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Prr29B1ARI9 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prr29B1ARI9 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prr29B1ARI9 Gm2594-201ENSMUST00000214774 742 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Prr29B1ARI9 Lilr4b-211ENSMUST00000219661 1143 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prr29B1ARI9 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms