Protein–RNA interactions for Protein: A3KG45

Gm6880, MCG1035527 (Fragment), mousemouse

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Length 208 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6880A3KG45 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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Gm6880A3KG45 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm6880A3KG45 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm6880A3KG45 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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Gm6880A3KG45 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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Gm6880A3KG45 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm6880A3KG45 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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Gm6880A3KG45 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
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Gm6880A3KG45 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
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Gm6880A3KG45 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
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Gm6880A3KG45 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
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Gm6880A3KG45 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
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Gm6880A3KG45 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
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Gm6880A3KG45 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm6880A3KG45 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm6880A3KG45 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm6880A3KG45 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm6880A3KG45 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm6880A3KG45 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm6880A3KG45 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm6880A3KG45 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm6880A3KG45 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm6880A3KG45 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm6880A3KG45 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm6880A3KG45 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm6880A3KG45 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm6880A3KG45 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm6880A3KG45 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm6880A3KG45 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm6880A3KG45 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm6880A3KG45 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm6880A3KG45 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm6880A3KG45 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm6880A3KG45 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm6880A3KG45 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms