Protein–RNA interactions for Protein: A3FIN4

Atp8b5, Phospholipid-transporting ATPase FetA, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b5A3FIN4 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atp8b5A3FIN4 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atp8b5A3FIN4 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atp8b5A3FIN4 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atp8b5A3FIN4 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atp8b5A3FIN4 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atp8b5A3FIN4 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atp8b5A3FIN4 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atp8b5A3FIN4 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atp8b5A3FIN4 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atp8b5A3FIN4 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atp8b5A3FIN4 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atp8b5A3FIN4 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atp8b5A3FIN4 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atp8b5A3FIN4 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atp8b5A3FIN4 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Atp8b5A3FIN4 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Atp8b5A3FIN4 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Atp8b5A3FIN4 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Atp8b5A3FIN4 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atp8b5A3FIN4 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atp8b5A3FIN4 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atp8b5A3FIN4 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atp8b5A3FIN4 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Atp8b5A3FIN4 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atp8b5A3FIN4 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atp8b5A3FIN4 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atp8b5A3FIN4 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atp8b5A3FIN4 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Atp8b5A3FIN4 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atp8b5A3FIN4 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atp8b5A3FIN4 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atp8b5A3FIN4 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atp8b5A3FIN4 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atp8b5A3FIN4 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atp8b5A3FIN4 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atp8b5A3FIN4 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atp8b5A3FIN4 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atp8b5A3FIN4 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atp8b5A3FIN4 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Atp8b5A3FIN4 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atp8b5A3FIN4 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atp8b5A3FIN4 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atp8b5A3FIN4 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atp8b5A3FIN4 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atp8b5A3FIN4 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atp8b5A3FIN4 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Atp8b5A3FIN4 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atp8b5A3FIN4 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atp8b5A3FIN4 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atp8b5A3FIN4 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atp8b5A3FIN4 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atp8b5A3FIN4 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atp8b5A3FIN4 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Atp8b5A3FIN4 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atp8b5A3FIN4 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atp8b5A3FIN4 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atp8b5A3FIN4 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atp8b5A3FIN4 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atp8b5A3FIN4 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atp8b5A3FIN4 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atp8b5A3FIN4 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atp8b5A3FIN4 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atp8b5A3FIN4 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atp8b5A3FIN4 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Atp8b5A3FIN4 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atp8b5A3FIN4 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atp8b5A3FIN4 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atp8b5A3FIN4 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atp8b5A3FIN4 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atp8b5A3FIN4 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atp8b5A3FIN4 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atp8b5A3FIN4 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atp8b5A3FIN4 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atp8b5A3FIN4 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atp8b5A3FIN4 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atp8b5A3FIN4 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atp8b5A3FIN4 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atp8b5A3FIN4 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atp8b5A3FIN4 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atp8b5A3FIN4 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atp8b5A3FIN4 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atp8b5A3FIN4 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atp8b5A3FIN4 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atp8b5A3FIN4 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atp8b5A3FIN4 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atp8b5A3FIN4 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atp8b5A3FIN4 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atp8b5A3FIN4 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atp8b5A3FIN4 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atp8b5A3FIN4 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atp8b5A3FIN4 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atp8b5A3FIN4 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atp8b5A3FIN4 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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