Protein–RNA interactions for Protein: A2VDH3

Lrrc38, Leucine-rich repeat-containing protein 38, mousemouse

Predictions only

Length 298 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc38A2VDH3 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrrc38A2VDH3 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrrc38A2VDH3 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrrc38A2VDH3 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrrc38A2VDH3 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrrc38A2VDH3 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrrc38A2VDH3 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrrc38A2VDH3 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrrc38A2VDH3 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrrc38A2VDH3 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrrc38A2VDH3 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrrc38A2VDH3 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrrc38A2VDH3 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrrc38A2VDH3 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrrc38A2VDH3 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrrc38A2VDH3 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrrc38A2VDH3 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrrc38A2VDH3 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrrc38A2VDH3 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrrc38A2VDH3 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrrc38A2VDH3 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrrc38A2VDH3 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrrc38A2VDH3 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrrc38A2VDH3 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrrc38A2VDH3 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrrc38A2VDH3 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrrc38A2VDH3 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrrc38A2VDH3 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrrc38A2VDH3 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrrc38A2VDH3 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrrc38A2VDH3 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Lrrc38A2VDH3 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Lrrc38A2VDH3 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrrc38A2VDH3 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrrc38A2VDH3 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrrc38A2VDH3 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrrc38A2VDH3 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrrc38A2VDH3 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrrc38A2VDH3 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrrc38A2VDH3 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrrc38A2VDH3 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrrc38A2VDH3 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrrc38A2VDH3 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrrc38A2VDH3 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrrc38A2VDH3 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrrc38A2VDH3 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrrc38A2VDH3 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrrc38A2VDH3 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrrc38A2VDH3 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrrc38A2VDH3 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrrc38A2VDH3 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrrc38A2VDH3 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrrc38A2VDH3 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrrc38A2VDH3 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrrc38A2VDH3 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrrc38A2VDH3 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrrc38A2VDH3 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrrc38A2VDH3 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrrc38A2VDH3 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrrc38A2VDH3 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrrc38A2VDH3 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrrc38A2VDH3 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrrc38A2VDH3 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrrc38A2VDH3 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrrc38A2VDH3 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrrc38A2VDH3 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrrc38A2VDH3 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrrc38A2VDH3 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrrc38A2VDH3 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrrc38A2VDH3 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrrc38A2VDH3 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrrc38A2VDH3 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrrc38A2VDH3 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrrc38A2VDH3 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrrc38A2VDH3 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrrc38A2VDH3 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrrc38A2VDH3 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrrc38A2VDH3 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrrc38A2VDH3 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrrc38A2VDH3 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrrc38A2VDH3 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrrc38A2VDH3 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrrc38A2VDH3 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrrc38A2VDH3 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrrc38A2VDH3 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrrc38A2VDH3 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrrc38A2VDH3 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrrc38A2VDH3 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrrc38A2VDH3 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrrc38A2VDH3 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrrc38A2VDH3 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrrc38A2VDH3 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrrc38A2VDH3 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrrc38A2VDH3 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrrc38A2VDH3 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrrc38A2VDH3 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrrc38A2VDH3 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrrc38A2VDH3 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrrc38A2VDH3 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrrc38A2VDH3 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms