Protein–RNA interactions for Protein: A2BED8

Samt1, Predicted gene 10057, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samt1A2BED8 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Samt1A2BED8 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Samt1A2BED8 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Samt1A2BED8 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Samt1A2BED8 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Samt1A2BED8 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Samt1A2BED8 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Samt1A2BED8 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Samt1A2BED8 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Samt1A2BED8 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Samt1A2BED8 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Samt1A2BED8 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Samt1A2BED8 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Samt1A2BED8 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Samt1A2BED8 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Samt1A2BED8 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Samt1A2BED8 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Samt1A2BED8 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Samt1A2BED8 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Samt1A2BED8 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Samt1A2BED8 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Samt1A2BED8 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Samt1A2BED8 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Samt1A2BED8 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Samt1A2BED8 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Samt1A2BED8 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Samt1A2BED8 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Samt1A2BED8 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Samt1A2BED8 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Samt1A2BED8 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Samt1A2BED8 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Samt1A2BED8 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Samt1A2BED8 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Samt1A2BED8 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Samt1A2BED8 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Samt1A2BED8 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Samt1A2BED8 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Samt1A2BED8 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Samt1A2BED8 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Samt1A2BED8 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Samt1A2BED8 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Samt1A2BED8 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Samt1A2BED8 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Samt1A2BED8 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Samt1A2BED8 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Samt1A2BED8 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Samt1A2BED8 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Samt1A2BED8 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Samt1A2BED8 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Samt1A2BED8 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Samt1A2BED8 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Samt1A2BED8 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Samt1A2BED8 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Samt1A2BED8 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Samt1A2BED8 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Samt1A2BED8 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Samt1A2BED8 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Samt1A2BED8 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Samt1A2BED8 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Samt1A2BED8 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Samt1A2BED8 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Samt1A2BED8 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Samt1A2BED8 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Samt1A2BED8 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Samt1A2BED8 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Samt1A2BED8 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Samt1A2BED8 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Samt1A2BED8 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Samt1A2BED8 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Samt1A2BED8 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Samt1A2BED8 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Samt1A2BED8 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Samt1A2BED8 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Samt1A2BED8 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Samt1A2BED8 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Samt1A2BED8 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Samt1A2BED8 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Samt1A2BED8 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Samt1A2BED8 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Samt1A2BED8 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Samt1A2BED8 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Samt1A2BED8 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Samt1A2BED8 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Samt1A2BED8 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Samt1A2BED8 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Samt1A2BED8 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Samt1A2BED8 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Samt1A2BED8 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Samt1A2BED8 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Samt1A2BED8 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Samt1A2BED8 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Samt1A2BED8 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Samt1A2BED8 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Samt1A2BED8 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Samt1A2BED8 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Samt1A2BED8 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Samt1A2BED8 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Samt1A2BED8 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Samt1A2BED8 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Samt1A2BED8 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms