Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ19

Rtf1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtf1A2AQ19 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rtf1A2AQ19 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rtf1A2AQ19 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rtf1A2AQ19 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rtf1A2AQ19 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Rtf1A2AQ19 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rtf1A2AQ19 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rtf1A2AQ19 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rtf1A2AQ19 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rtf1A2AQ19 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rtf1A2AQ19 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Rtf1A2AQ19 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rtf1A2AQ19 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rtf1A2AQ19 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rtf1A2AQ19 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rtf1A2AQ19 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Rtf1A2AQ19 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rtf1A2AQ19 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rtf1A2AQ19 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rtf1A2AQ19 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rtf1A2AQ19 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rtf1A2AQ19 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rtf1A2AQ19 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rtf1A2AQ19 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rtf1A2AQ19 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rtf1A2AQ19 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rtf1A2AQ19 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Rtf1A2AQ19 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rtf1A2AQ19 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rtf1A2AQ19 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rtf1A2AQ19 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rtf1A2AQ19 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rtf1A2AQ19 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rtf1A2AQ19 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rtf1A2AQ19 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rtf1A2AQ19 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rtf1A2AQ19 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rtf1A2AQ19 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rtf1A2AQ19 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rtf1A2AQ19 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rtf1A2AQ19 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rtf1A2AQ19 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rtf1A2AQ19 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rtf1A2AQ19 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Rtf1A2AQ19 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rtf1A2AQ19 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rtf1A2AQ19 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Rtf1A2AQ19 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rtf1A2AQ19 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Rtf1A2AQ19 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rtf1A2AQ19 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rtf1A2AQ19 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rtf1A2AQ19 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rtf1A2AQ19 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rtf1A2AQ19 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rtf1A2AQ19 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rtf1A2AQ19 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rtf1A2AQ19 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rtf1A2AQ19 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rtf1A2AQ19 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rtf1A2AQ19 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Rtf1A2AQ19 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rtf1A2AQ19 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rtf1A2AQ19 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rtf1A2AQ19 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rtf1A2AQ19 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rtf1A2AQ19 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rtf1A2AQ19 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rtf1A2AQ19 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rtf1A2AQ19 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rtf1A2AQ19 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rtf1A2AQ19 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rtf1A2AQ19 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rtf1A2AQ19 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rtf1A2AQ19 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rtf1A2AQ19 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rtf1A2AQ19 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Rtf1A2AQ19 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rtf1A2AQ19 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rtf1A2AQ19 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rtf1A2AQ19 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rtf1A2AQ19 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rtf1A2AQ19 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rtf1A2AQ19 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Rtf1A2AQ19 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rtf1A2AQ19 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rtf1A2AQ19 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rtf1A2AQ19 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rtf1A2AQ19 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rtf1A2AQ19 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Rtf1A2AQ19 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rtf1A2AQ19 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rtf1A2AQ19 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rtf1A2AQ19 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rtf1A2AQ19 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rtf1A2AQ19 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rtf1A2AQ19 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rtf1A2AQ19 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rtf1A2AQ19 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rtf1A2AQ19 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms