Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB9

Lcn6, LCN6 isoform alpha, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn6A2AJB9 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lcn6A2AJB9 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Lcn6A2AJB9 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lcn6A2AJB9 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lcn6A2AJB9 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lcn6A2AJB9 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lcn6A2AJB9 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lcn6A2AJB9 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lcn6A2AJB9 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lcn6A2AJB9 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lcn6A2AJB9 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lcn6A2AJB9 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lcn6A2AJB9 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lcn6A2AJB9 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lcn6A2AJB9 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lcn6A2AJB9 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lcn6A2AJB9 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lcn6A2AJB9 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lcn6A2AJB9 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lcn6A2AJB9 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lcn6A2AJB9 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lcn6A2AJB9 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lcn6A2AJB9 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lcn6A2AJB9 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lcn6A2AJB9 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lcn6A2AJB9 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lcn6A2AJB9 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Lcn6A2AJB9 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lcn6A2AJB9 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lcn6A2AJB9 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lcn6A2AJB9 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lcn6A2AJB9 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lcn6A2AJB9 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lcn6A2AJB9 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lcn6A2AJB9 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Lcn6A2AJB9 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lcn6A2AJB9 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lcn6A2AJB9 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lcn6A2AJB9 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lcn6A2AJB9 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lcn6A2AJB9 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lcn6A2AJB9 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lcn6A2AJB9 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lcn6A2AJB9 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lcn6A2AJB9 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lcn6A2AJB9 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lcn6A2AJB9 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lcn6A2AJB9 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lcn6A2AJB9 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lcn6A2AJB9 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lcn6A2AJB9 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lcn6A2AJB9 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lcn6A2AJB9 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lcn6A2AJB9 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lcn6A2AJB9 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lcn6A2AJB9 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
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Lcn6A2AJB9 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lcn6A2AJB9 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Lcn6A2AJB9 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Lcn6A2AJB9 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Lcn6A2AJB9 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
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Lcn6A2AJB9 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lcn6A2AJB9 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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Lcn6A2AJB9 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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Lcn6A2AJB9 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lcn6A2AJB9 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lcn6A2AJB9 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lcn6A2AJB9 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lcn6A2AJB9 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lcn6A2AJB9 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lcn6A2AJB9 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lcn6A2AJB9 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lcn6A2AJB9 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lcn6A2AJB9 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lcn6A2AJB9 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lcn6A2AJB9 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lcn6A2AJB9 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lcn6A2AJB9 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lcn6A2AJB9 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lcn6A2AJB9 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lcn6A2AJB9 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lcn6A2AJB9 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lcn6A2AJB9 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lcn6A2AJB9 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lcn6A2AJB9 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lcn6A2AJB9 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lcn6A2AJB9 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lcn6A2AJB9 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Lcn6A2AJB9 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Lcn6A2AJB9 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lcn6A2AJB9 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lcn6A2AJB9 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Lcn6A2AJB9 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms