Protein–RNA interactions for Protein: A2AHA7

Pramel3, Preferentially-expressed antigen in melanoma-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramel3A2AHA7 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pramel3A2AHA7 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pramel3A2AHA7 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pramel3A2AHA7 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Pramel3A2AHA7 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pramel3A2AHA7 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pramel3A2AHA7 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pramel3A2AHA7 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Pramel3A2AHA7 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pramel3A2AHA7 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pramel3A2AHA7 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pramel3A2AHA7 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pramel3A2AHA7 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pramel3A2AHA7 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pramel3A2AHA7 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pramel3A2AHA7 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pramel3A2AHA7 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pramel3A2AHA7 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pramel3A2AHA7 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pramel3A2AHA7 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Pramel3A2AHA7 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pramel3A2AHA7 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pramel3A2AHA7 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Pramel3A2AHA7 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pramel3A2AHA7 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pramel3A2AHA7 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pramel3A2AHA7 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pramel3A2AHA7 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pramel3A2AHA7 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pramel3A2AHA7 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pramel3A2AHA7 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pramel3A2AHA7 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pramel3A2AHA7 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pramel3A2AHA7 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pramel3A2AHA7 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Pramel3A2AHA7 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pramel3A2AHA7 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pramel3A2AHA7 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pramel3A2AHA7 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Pramel3A2AHA7 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Pramel3A2AHA7 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pramel3A2AHA7 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Pramel3A2AHA7 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pramel3A2AHA7 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Pramel3A2AHA7 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pramel3A2AHA7 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pramel3A2AHA7 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pramel3A2AHA7 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pramel3A2AHA7 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Pramel3A2AHA7 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Pramel3A2AHA7 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pramel3A2AHA7 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pramel3A2AHA7 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pramel3A2AHA7 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Pramel3A2AHA7 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pramel3A2AHA7 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pramel3A2AHA7 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pramel3A2AHA7 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pramel3A2AHA7 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pramel3A2AHA7 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pramel3A2AHA7 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pramel3A2AHA7 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pramel3A2AHA7 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pramel3A2AHA7 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pramel3A2AHA7 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pramel3A2AHA7 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pramel3A2AHA7 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pramel3A2AHA7 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pramel3A2AHA7 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pramel3A2AHA7 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pramel3A2AHA7 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pramel3A2AHA7 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pramel3A2AHA7 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pramel3A2AHA7 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pramel3A2AHA7 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pramel3A2AHA7 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pramel3A2AHA7 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pramel3A2AHA7 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pramel3A2AHA7 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pramel3A2AHA7 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pramel3A2AHA7 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pramel3A2AHA7 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Pramel3A2AHA7 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Pramel3A2AHA7 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pramel3A2AHA7 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Pramel3A2AHA7 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Pramel3A2AHA7 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pramel3A2AHA7 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pramel3A2AHA7 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pramel3A2AHA7 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Pramel3A2AHA7 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Pramel3A2AHA7 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Pramel3A2AHA7 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Pramel3A2AHA7 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pramel3A2AHA7 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Pramel3A2AHA7 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Pramel3A2AHA7 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pramel3A2AHA7 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
Pramel3A2AHA7 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pramel3A2AHA7 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms