Protein–RNA interactions for Protein: A2AH22

Ambra1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ambra1A2AH22 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ambra1A2AH22 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ambra1A2AH22 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ambra1A2AH22 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ambra1A2AH22 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ambra1A2AH22 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ambra1A2AH22 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ambra1A2AH22 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ambra1A2AH22 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ambra1A2AH22 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ambra1A2AH22 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ambra1A2AH22 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ambra1A2AH22 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ambra1A2AH22 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ambra1A2AH22 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ambra1A2AH22 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ambra1A2AH22 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ambra1A2AH22 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ambra1A2AH22 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ambra1A2AH22 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ambra1A2AH22 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ambra1A2AH22 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ambra1A2AH22 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ambra1A2AH22 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ambra1A2AH22 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ambra1A2AH22 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ambra1A2AH22 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ambra1A2AH22 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ambra1A2AH22 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ambra1A2AH22 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ambra1A2AH22 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ambra1A2AH22 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ambra1A2AH22 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ambra1A2AH22 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ambra1A2AH22 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ambra1A2AH22 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ambra1A2AH22 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ambra1A2AH22 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ambra1A2AH22 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ambra1A2AH22 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ambra1A2AH22 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ambra1A2AH22 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ambra1A2AH22 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ambra1A2AH22 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ambra1A2AH22 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ambra1A2AH22 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ambra1A2AH22 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ambra1A2AH22 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ambra1A2AH22 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ambra1A2AH22 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ambra1A2AH22 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ambra1A2AH22 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ambra1A2AH22 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ambra1A2AH22 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ambra1A2AH22 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ambra1A2AH22 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ambra1A2AH22 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ambra1A2AH22 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ambra1A2AH22 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ambra1A2AH22 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ambra1A2AH22 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ambra1A2AH22 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ambra1A2AH22 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ambra1A2AH22 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ambra1A2AH22 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ambra1A2AH22 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ambra1A2AH22 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ambra1A2AH22 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ambra1A2AH22 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ambra1A2AH22 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ambra1A2AH22 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ambra1A2AH22 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ambra1A2AH22 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ambra1A2AH22 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ambra1A2AH22 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ambra1A2AH22 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ambra1A2AH22 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ambra1A2AH22 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ambra1A2AH22 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ambra1A2AH22 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ambra1A2AH22 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ambra1A2AH22 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ambra1A2AH22 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ambra1A2AH22 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ambra1A2AH22 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ambra1A2AH22 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ambra1A2AH22 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ambra1A2AH22 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ambra1A2AH22 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ambra1A2AH22 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ambra1A2AH22 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ambra1A2AH22 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ambra1A2AH22 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ambra1A2AH22 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ambra1A2AH22 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ambra1A2AH22 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ambra1A2AH22 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ambra1A2AH22 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ambra1A2AH22 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ambra1A2AH22 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.4 ms