Protein–RNA interactions for Protein: A2AGT5

Ckap5, Cytoskeleton-associated protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap5A2AGT5 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ckap5A2AGT5 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ckap5A2AGT5 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Ckap5A2AGT5 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ckap5A2AGT5 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ckap5A2AGT5 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ckap5A2AGT5 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ckap5A2AGT5 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ckap5A2AGT5 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ckap5A2AGT5 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ckap5A2AGT5 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ckap5A2AGT5 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ckap5A2AGT5 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Ckap5A2AGT5 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ckap5A2AGT5 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ckap5A2AGT5 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ckap5A2AGT5 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ckap5A2AGT5 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ckap5A2AGT5 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ckap5A2AGT5 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ckap5A2AGT5 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ckap5A2AGT5 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ckap5A2AGT5 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ckap5A2AGT5 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ckap5A2AGT5 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ckap5A2AGT5 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ckap5A2AGT5 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ckap5A2AGT5 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Ckap5A2AGT5 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Ckap5A2AGT5 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ckap5A2AGT5 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ckap5A2AGT5 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Ckap5A2AGT5 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ckap5A2AGT5 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Ckap5A2AGT5 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ckap5A2AGT5 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Ckap5A2AGT5 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ckap5A2AGT5 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ckap5A2AGT5 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ckap5A2AGT5 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ckap5A2AGT5 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ckap5A2AGT5 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ckap5A2AGT5 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ckap5A2AGT5 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ckap5A2AGT5 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ckap5A2AGT5 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ckap5A2AGT5 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Ckap5A2AGT5 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Ckap5A2AGT5 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ckap5A2AGT5 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Ckap5A2AGT5 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Ckap5A2AGT5 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ckap5A2AGT5 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ckap5A2AGT5 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ckap5A2AGT5 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ckap5A2AGT5 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ckap5A2AGT5 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ckap5A2AGT5 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Ckap5A2AGT5 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ckap5A2AGT5 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ckap5A2AGT5 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ckap5A2AGT5 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Ckap5A2AGT5 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ckap5A2AGT5 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ckap5A2AGT5 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ckap5A2AGT5 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ckap5A2AGT5 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ckap5A2AGT5 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ckap5A2AGT5 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ckap5A2AGT5 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ckap5A2AGT5 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ckap5A2AGT5 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ckap5A2AGT5 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ckap5A2AGT5 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ckap5A2AGT5 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ckap5A2AGT5 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ckap5A2AGT5 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ckap5A2AGT5 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ckap5A2AGT5 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Ckap5A2AGT5 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ckap5A2AGT5 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ckap5A2AGT5 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ckap5A2AGT5 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ckap5A2AGT5 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ckap5A2AGT5 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ckap5A2AGT5 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ckap5A2AGT5 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ckap5A2AGT5 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ckap5A2AGT5 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Ckap5A2AGT5 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Ckap5A2AGT5 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ckap5A2AGT5 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Ckap5A2AGT5 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ckap5A2AGT5 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ckap5A2AGT5 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ckap5A2AGT5 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ckap5A2AGT5 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ckap5A2AGT5 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ckap5A2AGT5 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ckap5A2AGT5 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 111.5 ms