Protein–RNA interactions for Protein: A2AFR3

Frmpd4, FERM and PDZ domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd4A2AFR3 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Frmpd4A2AFR3 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Frmpd4A2AFR3 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Frmpd4A2AFR3 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Frmpd4A2AFR3 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Frmpd4A2AFR3 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Frmpd4A2AFR3 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Frmpd4A2AFR3 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Frmpd4A2AFR3 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Frmpd4A2AFR3 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Frmpd4A2AFR3 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Frmpd4A2AFR3 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Frmpd4A2AFR3 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Frmpd4A2AFR3 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Frmpd4A2AFR3 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Frmpd4A2AFR3 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Frmpd4A2AFR3 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Frmpd4A2AFR3 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Frmpd4A2AFR3 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Frmpd4A2AFR3 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Frmpd4A2AFR3 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Frmpd4A2AFR3 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Frmpd4A2AFR3 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Frmpd4A2AFR3 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Frmpd4A2AFR3 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Frmpd4A2AFR3 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Frmpd4A2AFR3 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Frmpd4A2AFR3 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Frmpd4A2AFR3 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Frmpd4A2AFR3 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Frmpd4A2AFR3 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Frmpd4A2AFR3 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Frmpd4A2AFR3 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Frmpd4A2AFR3 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Frmpd4A2AFR3 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Frmpd4A2AFR3 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Frmpd4A2AFR3 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Frmpd4A2AFR3 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Frmpd4A2AFR3 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Frmpd4A2AFR3 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Frmpd4A2AFR3 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Frmpd4A2AFR3 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Frmpd4A2AFR3 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Frmpd4A2AFR3 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Frmpd4A2AFR3 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Frmpd4A2AFR3 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Frmpd4A2AFR3 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Frmpd4A2AFR3 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Frmpd4A2AFR3 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Frmpd4A2AFR3 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Frmpd4A2AFR3 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Frmpd4A2AFR3 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Frmpd4A2AFR3 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Frmpd4A2AFR3 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Frmpd4A2AFR3 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Frmpd4A2AFR3 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Frmpd4A2AFR3 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Frmpd4A2AFR3 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Frmpd4A2AFR3 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Frmpd4A2AFR3 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Frmpd4A2AFR3 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Frmpd4A2AFR3 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Frmpd4A2AFR3 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Frmpd4A2AFR3 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Frmpd4A2AFR3 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Frmpd4A2AFR3 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Frmpd4A2AFR3 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Frmpd4A2AFR3 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Frmpd4A2AFR3 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Frmpd4A2AFR3 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Frmpd4A2AFR3 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Frmpd4A2AFR3 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Frmpd4A2AFR3 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Frmpd4A2AFR3 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Frmpd4A2AFR3 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Frmpd4A2AFR3 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Frmpd4A2AFR3 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Frmpd4A2AFR3 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Frmpd4A2AFR3 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Frmpd4A2AFR3 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Frmpd4A2AFR3 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Frmpd4A2AFR3 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Frmpd4A2AFR3 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Frmpd4A2AFR3 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Frmpd4A2AFR3 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Frmpd4A2AFR3 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Frmpd4A2AFR3 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Frmpd4A2AFR3 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Frmpd4A2AFR3 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Frmpd4A2AFR3 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Frmpd4A2AFR3 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Frmpd4A2AFR3 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Frmpd4A2AFR3 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Frmpd4A2AFR3 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Frmpd4A2AFR3 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Frmpd4A2AFR3 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Frmpd4A2AFR3 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Frmpd4A2AFR3 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Frmpd4A2AFR3 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Frmpd4A2AFR3 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.5 ms