Protein–RNA interactions for Protein: A2A8L5

Ptprf, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, mousemouse

Predictions only

Length 1,898 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprfA2A8L5 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PtprfA2A8L5 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PtprfA2A8L5 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
PtprfA2A8L5 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
PtprfA2A8L5 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
PtprfA2A8L5 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PtprfA2A8L5 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
PtprfA2A8L5 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PtprfA2A8L5 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PtprfA2A8L5 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PtprfA2A8L5 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PtprfA2A8L5 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PtprfA2A8L5 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PtprfA2A8L5 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PtprfA2A8L5 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
PtprfA2A8L5 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PtprfA2A8L5 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PtprfA2A8L5 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PtprfA2A8L5 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PtprfA2A8L5 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PtprfA2A8L5 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
PtprfA2A8L5 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PtprfA2A8L5 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PtprfA2A8L5 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
PtprfA2A8L5 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PtprfA2A8L5 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PtprfA2A8L5 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PtprfA2A8L5 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PtprfA2A8L5 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PtprfA2A8L5 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
PtprfA2A8L5 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
PtprfA2A8L5 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
PtprfA2A8L5 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PtprfA2A8L5 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PtprfA2A8L5 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PtprfA2A8L5 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PtprfA2A8L5 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PtprfA2A8L5 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PtprfA2A8L5 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PtprfA2A8L5 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PtprfA2A8L5 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PtprfA2A8L5 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PtprfA2A8L5 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PtprfA2A8L5 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PtprfA2A8L5 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PtprfA2A8L5 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PtprfA2A8L5 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PtprfA2A8L5 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PtprfA2A8L5 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PtprfA2A8L5 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PtprfA2A8L5 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PtprfA2A8L5 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PtprfA2A8L5 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PtprfA2A8L5 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
PtprfA2A8L5 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PtprfA2A8L5 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
PtprfA2A8L5 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PtprfA2A8L5 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PtprfA2A8L5 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
PtprfA2A8L5 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PtprfA2A8L5 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PtprfA2A8L5 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PtprfA2A8L5 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PtprfA2A8L5 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PtprfA2A8L5 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
PtprfA2A8L5 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
PtprfA2A8L5 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
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PtprfA2A8L5 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PtprfA2A8L5 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PtprfA2A8L5 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PtprfA2A8L5 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PtprfA2A8L5 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PtprfA2A8L5 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PtprfA2A8L5 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PtprfA2A8L5 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PtprfA2A8L5 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PtprfA2A8L5 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PtprfA2A8L5 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PtprfA2A8L5 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PtprfA2A8L5 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PtprfA2A8L5 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
PtprfA2A8L5 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PtprfA2A8L5 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PtprfA2A8L5 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
PtprfA2A8L5 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PtprfA2A8L5 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PtprfA2A8L5 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
PtprfA2A8L5 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PtprfA2A8L5 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PtprfA2A8L5 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PtprfA2A8L5 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PtprfA2A8L5 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PtprfA2A8L5 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PtprfA2A8L5 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PtprfA2A8L5 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PtprfA2A8L5 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PtprfA2A8L5 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PtprfA2A8L5 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PtprfA2A8L5 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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