Protein–RNA interactions for Protein: A2A7B5

Prdm2, PR domain-containing 2, with ZNF domain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm2A2A7B5 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prdm2A2A7B5 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Prdm2A2A7B5 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prdm2A2A7B5 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prdm2A2A7B5 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Prdm2A2A7B5 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
Prdm2A2A7B5 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Prdm2A2A7B5 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
Prdm2A2A7B5 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
Prdm2A2A7B5 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prdm2A2A7B5 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prdm2A2A7B5 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prdm2A2A7B5 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prdm2A2A7B5 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prdm2A2A7B5 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prdm2A2A7B5 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Prdm2A2A7B5 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prdm2A2A7B5 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prdm2A2A7B5 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prdm2A2A7B5 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Prdm2A2A7B5 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prdm2A2A7B5 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prdm2A2A7B5 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prdm2A2A7B5 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prdm2A2A7B5 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prdm2A2A7B5 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prdm2A2A7B5 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prdm2A2A7B5 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Prdm2A2A7B5 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prdm2A2A7B5 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Prdm2A2A7B5 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prdm2A2A7B5 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prdm2A2A7B5 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prdm2A2A7B5 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prdm2A2A7B5 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prdm2A2A7B5 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prdm2A2A7B5 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prdm2A2A7B5 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Prdm2A2A7B5 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Prdm2A2A7B5 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prdm2A2A7B5 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prdm2A2A7B5 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prdm2A2A7B5 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prdm2A2A7B5 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prdm2A2A7B5 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prdm2A2A7B5 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prdm2A2A7B5 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prdm2A2A7B5 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prdm2A2A7B5 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prdm2A2A7B5 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prdm2A2A7B5 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prdm2A2A7B5 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prdm2A2A7B5 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prdm2A2A7B5 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prdm2A2A7B5 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prdm2A2A7B5 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prdm2A2A7B5 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prdm2A2A7B5 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prdm2A2A7B5 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prdm2A2A7B5 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prdm2A2A7B5 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prdm2A2A7B5 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Prdm2A2A7B5 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prdm2A2A7B5 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prdm2A2A7B5 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prdm2A2A7B5 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prdm2A2A7B5 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prdm2A2A7B5 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prdm2A2A7B5 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prdm2A2A7B5 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prdm2A2A7B5 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prdm2A2A7B5 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prdm2A2A7B5 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prdm2A2A7B5 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prdm2A2A7B5 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prdm2A2A7B5 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prdm2A2A7B5 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prdm2A2A7B5 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prdm2A2A7B5 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Prdm2A2A7B5 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prdm2A2A7B5 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Prdm2A2A7B5 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prdm2A2A7B5 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Prdm2A2A7B5 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Prdm2A2A7B5 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prdm2A2A7B5 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prdm2A2A7B5 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prdm2A2A7B5 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prdm2A2A7B5 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prdm2A2A7B5 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prdm2A2A7B5 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prdm2A2A7B5 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prdm2A2A7B5 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prdm2A2A7B5 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prdm2A2A7B5 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prdm2A2A7B5 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prdm2A2A7B5 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prdm2A2A7B5 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prdm2A2A7B5 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prdm2A2A7B5 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms