Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP1

Speer3, MCG129800, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer3W4VSP1 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Speer3W4VSP1 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Speer3W4VSP1 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Speer3W4VSP1 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Speer3W4VSP1 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Speer3W4VSP1 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Speer3W4VSP1 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Speer3W4VSP1 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Speer3W4VSP1 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Speer3W4VSP1 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Speer3W4VSP1 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Speer3W4VSP1 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Speer3W4VSP1 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Speer3W4VSP1 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Speer3W4VSP1 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Speer3W4VSP1 Gm43316-201ENSMUST00000197252 1295 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Speer3W4VSP1 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Speer3W4VSP1 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Speer3W4VSP1 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Speer3W4VSP1 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Speer3W4VSP1 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Speer3W4VSP1 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Speer3W4VSP1 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Speer3W4VSP1 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Speer3W4VSP1 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Speer3W4VSP1 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Speer3W4VSP1 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Speer3W4VSP1 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Speer3W4VSP1 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Speer3W4VSP1 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Speer3W4VSP1 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Speer3W4VSP1 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Speer3W4VSP1 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Speer3W4VSP1 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Speer3W4VSP1 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Speer3W4VSP1 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Speer3W4VSP1 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Speer3W4VSP1 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Speer3W4VSP1 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Speer3W4VSP1 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Speer3W4VSP1 Ifna2-201ENSMUST00000105147 1032 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Speer3W4VSP1 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Speer3W4VSP1 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Speer3W4VSP1 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Speer3W4VSP1 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Speer3W4VSP1 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Speer3W4VSP1 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Speer3W4VSP1 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Speer3W4VSP1 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Speer3W4VSP1 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Speer3W4VSP1 CT025561.1-201ENSMUST00000214972 674 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Speer3W4VSP1 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Speer3W4VSP1 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Speer3W4VSP1 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Speer3W4VSP1 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Speer3W4VSP1 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Speer3W4VSP1 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Speer3W4VSP1 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Speer3W4VSP1 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Speer3W4VSP1 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Speer3W4VSP1 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Speer3W4VSP1 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Speer3W4VSP1 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Speer3W4VSP1 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Speer3W4VSP1 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Speer3W4VSP1 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Speer3W4VSP1 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Speer3W4VSP1 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Speer3W4VSP1 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Speer3W4VSP1 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Speer3W4VSP1 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Speer3W4VSP1 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Speer3W4VSP1 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Speer3W4VSP1 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Speer3W4VSP1 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Speer3W4VSP1 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Speer3W4VSP1 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Speer3W4VSP1 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Speer3W4VSP1 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Speer3W4VSP1 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Speer3W4VSP1 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Speer3W4VSP1 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Speer3W4VSP1 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Speer3W4VSP1 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Speer3W4VSP1 Ica1-202ENSMUST00000115518 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Speer3W4VSP1 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Speer3W4VSP1 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Speer3W4VSP1 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Speer3W4VSP1 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Speer3W4VSP1 Bud31-203ENSMUST00000160075 928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Speer3W4VSP1 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Speer3W4VSP1 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Speer3W4VSP1 Gm17790-201ENSMUST00000191545 1228 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Speer3W4VSP1 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Speer3W4VSP1 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Speer3W4VSP1 Olfr1233-204ENSMUST00000216561 1192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Speer3W4VSP1 AC116589.3-201ENSMUST00000223034 1165 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Speer3W4VSP1 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Speer3W4VSP1 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Speer3W4VSP1 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
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