Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN7

Gm3550, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3550W4VSN7 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm3550W4VSN7 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm3550W4VSN7 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm3550W4VSN7 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm3550W4VSN7 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm3550W4VSN7 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm3550W4VSN7 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm3550W4VSN7 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm3550W4VSN7 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm3550W4VSN7 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm3550W4VSN7 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm3550W4VSN7 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm3550W4VSN7 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm3550W4VSN7 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm3550W4VSN7 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm3550W4VSN7 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm3550W4VSN7 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm3550W4VSN7 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm3550W4VSN7 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm3550W4VSN7 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm3550W4VSN7 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm3550W4VSN7 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm3550W4VSN7 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm3550W4VSN7 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm3550W4VSN7 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm3550W4VSN7 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm3550W4VSN7 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm3550W4VSN7 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm3550W4VSN7 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm3550W4VSN7 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm3550W4VSN7 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm3550W4VSN7 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm3550W4VSN7 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm3550W4VSN7 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm3550W4VSN7 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm3550W4VSN7 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm3550W4VSN7 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm3550W4VSN7 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm3550W4VSN7 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm3550W4VSN7 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm3550W4VSN7 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm3550W4VSN7 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm3550W4VSN7 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm3550W4VSN7 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm3550W4VSN7 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm3550W4VSN7 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm3550W4VSN7 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm3550W4VSN7 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm3550W4VSN7 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm3550W4VSN7 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm3550W4VSN7 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm3550W4VSN7 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm3550W4VSN7 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm3550W4VSN7 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm3550W4VSN7 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm3550W4VSN7 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm3550W4VSN7 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm3550W4VSN7 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm3550W4VSN7 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm3550W4VSN7 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm3550W4VSN7 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm3550W4VSN7 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm3550W4VSN7 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm3550W4VSN7 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm3550W4VSN7 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm3550W4VSN7 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm3550W4VSN7 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm3550W4VSN7 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm3550W4VSN7 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm3550W4VSN7 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm3550W4VSN7 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm3550W4VSN7 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm3550W4VSN7 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm3550W4VSN7 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm3550W4VSN7 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm3550W4VSN7 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm3550W4VSN7 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm3550W4VSN7 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm3550W4VSN7 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm3550W4VSN7 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm3550W4VSN7 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm3550W4VSN7 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm3550W4VSN7 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm3550W4VSN7 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm3550W4VSN7 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm3550W4VSN7 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm3550W4VSN7 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm3550W4VSN7 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm3550W4VSN7 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm3550W4VSN7 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm3550W4VSN7 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm3550W4VSN7 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm3550W4VSN7 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm3550W4VSN7 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm3550W4VSN7 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm3550W4VSN7 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm3550W4VSN7 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm3550W4VSN7 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm3550W4VSN7 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm3550W4VSN7 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms