Protein–RNA interactions for Protein: T1NXB5

Vstm4, V-set and transmembrane domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm4T1NXB5 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Vstm4T1NXB5 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Vstm4T1NXB5 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Vstm4T1NXB5 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Vstm4T1NXB5 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Vstm4T1NXB5 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vstm4T1NXB5 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Vstm4T1NXB5 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vstm4T1NXB5 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vstm4T1NXB5 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vstm4T1NXB5 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Vstm4T1NXB5 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vstm4T1NXB5 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vstm4T1NXB5 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vstm4T1NXB5 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Vstm4T1NXB5 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vstm4T1NXB5 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vstm4T1NXB5 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Vstm4T1NXB5 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vstm4T1NXB5 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vstm4T1NXB5 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vstm4T1NXB5 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vstm4T1NXB5 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vstm4T1NXB5 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vstm4T1NXB5 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Vstm4T1NXB5 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vstm4T1NXB5 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vstm4T1NXB5 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vstm4T1NXB5 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vstm4T1NXB5 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vstm4T1NXB5 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vstm4T1NXB5 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vstm4T1NXB5 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vstm4T1NXB5 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vstm4T1NXB5 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vstm4T1NXB5 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vstm4T1NXB5 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vstm4T1NXB5 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vstm4T1NXB5 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Vstm4T1NXB5 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vstm4T1NXB5 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vstm4T1NXB5 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vstm4T1NXB5 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vstm4T1NXB5 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vstm4T1NXB5 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vstm4T1NXB5 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vstm4T1NXB5 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vstm4T1NXB5 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Vstm4T1NXB5 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vstm4T1NXB5 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vstm4T1NXB5 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vstm4T1NXB5 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vstm4T1NXB5 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vstm4T1NXB5 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vstm4T1NXB5 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vstm4T1NXB5 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vstm4T1NXB5 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vstm4T1NXB5 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vstm4T1NXB5 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vstm4T1NXB5 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vstm4T1NXB5 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vstm4T1NXB5 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Vstm4T1NXB5 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vstm4T1NXB5 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vstm4T1NXB5 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vstm4T1NXB5 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vstm4T1NXB5 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Vstm4T1NXB5 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Vstm4T1NXB5 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vstm4T1NXB5 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Vstm4T1NXB5 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vstm4T1NXB5 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vstm4T1NXB5 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vstm4T1NXB5 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vstm4T1NXB5 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vstm4T1NXB5 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vstm4T1NXB5 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vstm4T1NXB5 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Vstm4T1NXB5 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Vstm4T1NXB5 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vstm4T1NXB5 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vstm4T1NXB5 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vstm4T1NXB5 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vstm4T1NXB5 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vstm4T1NXB5 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vstm4T1NXB5 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vstm4T1NXB5 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vstm4T1NXB5 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vstm4T1NXB5 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vstm4T1NXB5 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vstm4T1NXB5 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vstm4T1NXB5 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Vstm4T1NXB5 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vstm4T1NXB5 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vstm4T1NXB5 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vstm4T1NXB5 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vstm4T1NXB5 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vstm4T1NXB5 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vstm4T1NXB5 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vstm4T1NXB5 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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