Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q5

Mrpl40, 39S ribosomal protein L40, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl40Q9Z2Q5 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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