Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2M6

Ubl3, Ubiquitin-like protein 3, mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl3Q9Z2M6 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ubl3Q9Z2M6 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ubl3Q9Z2M6 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ubl3Q9Z2M6 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ubl3Q9Z2M6 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ubl3Q9Z2M6 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ubl3Q9Z2M6 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ubl3Q9Z2M6 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ubl3Q9Z2M6 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ubl3Q9Z2M6 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ubl3Q9Z2M6 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ubl3Q9Z2M6 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ubl3Q9Z2M6 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ubl3Q9Z2M6 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ubl3Q9Z2M6 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ubl3Q9Z2M6 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ubl3Q9Z2M6 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Ubl3Q9Z2M6 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ubl3Q9Z2M6 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ubl3Q9Z2M6 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Ubl3Q9Z2M6 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ubl3Q9Z2M6 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ubl3Q9Z2M6 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ubl3Q9Z2M6 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ubl3Q9Z2M6 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ubl3Q9Z2M6 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ubl3Q9Z2M6 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ubl3Q9Z2M6 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Ubl3Q9Z2M6 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ubl3Q9Z2M6 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ubl3Q9Z2M6 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ubl3Q9Z2M6 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ubl3Q9Z2M6 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ubl3Q9Z2M6 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ubl3Q9Z2M6 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ubl3Q9Z2M6 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ubl3Q9Z2M6 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ubl3Q9Z2M6 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ubl3Q9Z2M6 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ubl3Q9Z2M6 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ubl3Q9Z2M6 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ubl3Q9Z2M6 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ubl3Q9Z2M6 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ubl3Q9Z2M6 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ubl3Q9Z2M6 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Ubl3Q9Z2M6 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ubl3Q9Z2M6 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ubl3Q9Z2M6 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ubl3Q9Z2M6 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ubl3Q9Z2M6 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ubl3Q9Z2M6 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ubl3Q9Z2M6 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ubl3Q9Z2M6 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ubl3Q9Z2M6 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ubl3Q9Z2M6 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ubl3Q9Z2M6 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ubl3Q9Z2M6 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ubl3Q9Z2M6 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ubl3Q9Z2M6 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ubl3Q9Z2M6 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ubl3Q9Z2M6 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ubl3Q9Z2M6 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Ubl3Q9Z2M6 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ubl3Q9Z2M6 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ubl3Q9Z2M6 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ubl3Q9Z2M6 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ubl3Q9Z2M6 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Ubl3Q9Z2M6 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ubl3Q9Z2M6 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ubl3Q9Z2M6 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ubl3Q9Z2M6 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ubl3Q9Z2M6 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ubl3Q9Z2M6 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ubl3Q9Z2M6 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ubl3Q9Z2M6 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ubl3Q9Z2M6 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ubl3Q9Z2M6 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ubl3Q9Z2M6 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ubl3Q9Z2M6 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ubl3Q9Z2M6 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ubl3Q9Z2M6 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ubl3Q9Z2M6 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ubl3Q9Z2M6 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ubl3Q9Z2M6 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ubl3Q9Z2M6 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ubl3Q9Z2M6 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ubl3Q9Z2M6 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ubl3Q9Z2M6 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ubl3Q9Z2M6 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ubl3Q9Z2M6 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ubl3Q9Z2M6 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ubl3Q9Z2M6 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ubl3Q9Z2M6 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ubl3Q9Z2M6 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ubl3Q9Z2M6 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ubl3Q9Z2M6 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Ubl3Q9Z2M6 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
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