Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2A0

Pdpk1, 3-phosphoinositide-dependent protein kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdpk1Q9Z2A0 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pdpk1Q9Z2A0 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pdpk1Q9Z2A0 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pdpk1Q9Z2A0 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pdpk1Q9Z2A0 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pdpk1Q9Z2A0 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pdpk1Q9Z2A0 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pdpk1Q9Z2A0 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pdpk1Q9Z2A0 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms