Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV89

Stxbp4, Syntaxin-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stxbp4Q9WV89 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stxbp4Q9WV89 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stxbp4Q9WV89 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stxbp4Q9WV89 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stxbp4Q9WV89 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stxbp4Q9WV89 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stxbp4Q9WV89 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Stxbp4Q9WV89 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stxbp4Q9WV89 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stxbp4Q9WV89 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stxbp4Q9WV89 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stxbp4Q9WV89 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stxbp4Q9WV89 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stxbp4Q9WV89 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stxbp4Q9WV89 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Stxbp4Q9WV89 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stxbp4Q9WV89 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stxbp4Q9WV89 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stxbp4Q9WV89 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stxbp4Q9WV89 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stxbp4Q9WV89 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stxbp4Q9WV89 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stxbp4Q9WV89 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stxbp4Q9WV89 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stxbp4Q9WV89 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stxbp4Q9WV89 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stxbp4Q9WV89 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stxbp4Q9WV89 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stxbp4Q9WV89 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stxbp4Q9WV89 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stxbp4Q9WV89 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stxbp4Q9WV89 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stxbp4Q9WV89 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stxbp4Q9WV89 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stxbp4Q9WV89 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stxbp4Q9WV89 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stxbp4Q9WV89 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stxbp4Q9WV89 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stxbp4Q9WV89 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stxbp4Q9WV89 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stxbp4Q9WV89 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stxbp4Q9WV89 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stxbp4Q9WV89 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Stxbp4Q9WV89 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stxbp4Q9WV89 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Stxbp4Q9WV89 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stxbp4Q9WV89 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Stxbp4Q9WV89 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stxbp4Q9WV89 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stxbp4Q9WV89 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stxbp4Q9WV89 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stxbp4Q9WV89 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stxbp4Q9WV89 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stxbp4Q9WV89 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stxbp4Q9WV89 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stxbp4Q9WV89 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stxbp4Q9WV89 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stxbp4Q9WV89 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stxbp4Q9WV89 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stxbp4Q9WV89 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stxbp4Q9WV89 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stxbp4Q9WV89 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stxbp4Q9WV89 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stxbp4Q9WV89 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stxbp4Q9WV89 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stxbp4Q9WV89 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stxbp4Q9WV89 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stxbp4Q9WV89 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stxbp4Q9WV89 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stxbp4Q9WV89 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stxbp4Q9WV89 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stxbp4Q9WV89 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stxbp4Q9WV89 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stxbp4Q9WV89 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stxbp4Q9WV89 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stxbp4Q9WV89 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stxbp4Q9WV89 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stxbp4Q9WV89 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stxbp4Q9WV89 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Stxbp4Q9WV89 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stxbp4Q9WV89 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stxbp4Q9WV89 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stxbp4Q9WV89 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stxbp4Q9WV89 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stxbp4Q9WV89 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stxbp4Q9WV89 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stxbp4Q9WV89 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stxbp4Q9WV89 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stxbp4Q9WV89 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stxbp4Q9WV89 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stxbp4Q9WV89 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stxbp4Q9WV89 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stxbp4Q9WV89 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stxbp4Q9WV89 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stxbp4Q9WV89 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stxbp4Q9WV89 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stxbp4Q9WV89 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stxbp4Q9WV89 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stxbp4Q9WV89 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stxbp4Q9WV89 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms