Protein–RNA interactions for Protein: Q9R244

Trpc2, Short transient receptor potential channel 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc2Q9R244 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Trpc2Q9R244 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Trpc2Q9R244 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Trpc2Q9R244 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Trpc2Q9R244 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Trpc2Q9R244 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Trpc2Q9R244 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Trpc2Q9R244 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Trpc2Q9R244 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Trpc2Q9R244 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Trpc2Q9R244 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Trpc2Q9R244 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Trpc2Q9R244 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Trpc2Q9R244 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Trpc2Q9R244 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Trpc2Q9R244 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Trpc2Q9R244 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Trpc2Q9R244 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Trpc2Q9R244 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Trpc2Q9R244 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
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Trpc2Q9R244 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Trpc2Q9R244 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Trpc2Q9R244 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Trpc2Q9R244 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Trpc2Q9R244 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Trpc2Q9R244 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Trpc2Q9R244 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
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Trpc2Q9R244 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Trpc2Q9R244 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Trpc2Q9R244 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Trpc2Q9R244 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Trpc2Q9R244 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Trpc2Q9R244 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Trpc2Q9R244 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Trpc2Q9R244 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
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Trpc2Q9R244 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Trpc2Q9R244 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trpc2Q9R244 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trpc2Q9R244 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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Trpc2Q9R244 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trpc2Q9R244 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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Trpc2Q9R244 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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Trpc2Q9R244 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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Trpc2Q9R244 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trpc2Q9R244 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trpc2Q9R244 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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Trpc2Q9R244 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trpc2Q9R244 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trpc2Q9R244 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trpc2Q9R244 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trpc2Q9R244 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trpc2Q9R244 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trpc2Q9R244 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trpc2Q9R244 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trpc2Q9R244 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trpc2Q9R244 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trpc2Q9R244 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trpc2Q9R244 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trpc2Q9R244 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trpc2Q9R244 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trpc2Q9R244 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trpc2Q9R244 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trpc2Q9R244 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trpc2Q9R244 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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