Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0B6

Lamc3, Laminin subunit gamma-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamc3Q9R0B6 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lamc3Q9R0B6 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lamc3Q9R0B6 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lamc3Q9R0B6 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lamc3Q9R0B6 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lamc3Q9R0B6 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Lamc3Q9R0B6 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lamc3Q9R0B6 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lamc3Q9R0B6 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Lamc3Q9R0B6 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Lamc3Q9R0B6 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Lamc3Q9R0B6 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lamc3Q9R0B6 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Lamc3Q9R0B6 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Lamc3Q9R0B6 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lamc3Q9R0B6 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Lamc3Q9R0B6 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Lamc3Q9R0B6 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lamc3Q9R0B6 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lamc3Q9R0B6 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lamc3Q9R0B6 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lamc3Q9R0B6 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lamc3Q9R0B6 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lamc3Q9R0B6 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lamc3Q9R0B6 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lamc3Q9R0B6 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lamc3Q9R0B6 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lamc3Q9R0B6 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lamc3Q9R0B6 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Lamc3Q9R0B6 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Lamc3Q9R0B6 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Lamc3Q9R0B6 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lamc3Q9R0B6 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lamc3Q9R0B6 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lamc3Q9R0B6 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lamc3Q9R0B6 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lamc3Q9R0B6 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lamc3Q9R0B6 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lamc3Q9R0B6 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lamc3Q9R0B6 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lamc3Q9R0B6 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lamc3Q9R0B6 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lamc3Q9R0B6 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lamc3Q9R0B6 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lamc3Q9R0B6 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Lamc3Q9R0B6 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lamc3Q9R0B6 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Lamc3Q9R0B6 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Lamc3Q9R0B6 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lamc3Q9R0B6 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Lamc3Q9R0B6 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Lamc3Q9R0B6 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Lamc3Q9R0B6 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Lamc3Q9R0B6 Sst-201ENSMUST00000004480 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lamc3Q9R0B6 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Lamc3Q9R0B6 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lamc3Q9R0B6 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lamc3Q9R0B6 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lamc3Q9R0B6 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Lamc3Q9R0B6 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Lamc3Q9R0B6 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lamc3Q9R0B6 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lamc3Q9R0B6 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Lamc3Q9R0B6 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lamc3Q9R0B6 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lamc3Q9R0B6 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Lamc3Q9R0B6 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Lamc3Q9R0B6 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lamc3Q9R0B6 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lamc3Q9R0B6 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lamc3Q9R0B6 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lamc3Q9R0B6 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lamc3Q9R0B6 Mir6958-201ENSMUST00000184207 73 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Lamc3Q9R0B6 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Lamc3Q9R0B6 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Lamc3Q9R0B6 4930596D02Rik-201ENSMUST00000043266 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lamc3Q9R0B6 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lamc3Q9R0B6 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lamc3Q9R0B6 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Lamc3Q9R0B6 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Lamc3Q9R0B6 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lamc3Q9R0B6 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lamc3Q9R0B6 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lamc3Q9R0B6 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lamc3Q9R0B6 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lamc3Q9R0B6 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lamc3Q9R0B6 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lamc3Q9R0B6 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Lamc3Q9R0B6 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lamc3Q9R0B6 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Lamc3Q9R0B6 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lamc3Q9R0B6 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Lamc3Q9R0B6 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lamc3Q9R0B6 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Lamc3Q9R0B6 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Lamc3Q9R0B6 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Lamc3Q9R0B6 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lamc3Q9R0B6 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lamc3Q9R0B6 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lamc3Q9R0B6 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms