Protein–RNA interactions for Protein: Q9R049

Amfr, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, mousemouse

Predictions only

Length 643 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmfrQ9R049 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
AmfrQ9R049 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
AmfrQ9R049 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
AmfrQ9R049 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
AmfrQ9R049 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
AmfrQ9R049 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
AmfrQ9R049 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
AmfrQ9R049 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
AmfrQ9R049 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
AmfrQ9R049 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
AmfrQ9R049 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
AmfrQ9R049 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
AmfrQ9R049 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
AmfrQ9R049 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
AmfrQ9R049 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
AmfrQ9R049 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
AmfrQ9R049 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
AmfrQ9R049 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
AmfrQ9R049 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
AmfrQ9R049 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
AmfrQ9R049 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
AmfrQ9R049 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
AmfrQ9R049 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
AmfrQ9R049 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
AmfrQ9R049 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
AmfrQ9R049 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
AmfrQ9R049 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
AmfrQ9R049 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
AmfrQ9R049 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
AmfrQ9R049 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
AmfrQ9R049 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
AmfrQ9R049 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
AmfrQ9R049 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
AmfrQ9R049 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
AmfrQ9R049 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
AmfrQ9R049 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
AmfrQ9R049 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
AmfrQ9R049 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
AmfrQ9R049 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
AmfrQ9R049 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
AmfrQ9R049 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
AmfrQ9R049 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
AmfrQ9R049 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
AmfrQ9R049 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
AmfrQ9R049 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
AmfrQ9R049 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
AmfrQ9R049 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
AmfrQ9R049 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC15□□□□□ -0.01
AmfrQ9R049 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC15□□□□□ -0.01
AmfrQ9R049 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC15□□□□□ -0.01
AmfrQ9R049 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
AmfrQ9R049 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
AmfrQ9R049 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
AmfrQ9R049 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
AmfrQ9R049 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
AmfrQ9R049 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
AmfrQ9R049 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
AmfrQ9R049 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
AmfrQ9R049 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
AmfrQ9R049 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
AmfrQ9R049 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
AmfrQ9R049 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
AmfrQ9R049 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
AmfrQ9R049 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
AmfrQ9R049 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
AmfrQ9R049 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
AmfrQ9R049 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
AmfrQ9R049 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
AmfrQ9R049 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
AmfrQ9R049 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
AmfrQ9R049 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
AmfrQ9R049 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
AmfrQ9R049 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
AmfrQ9R049 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
AmfrQ9R049 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
AmfrQ9R049 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
AmfrQ9R049 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
AmfrQ9R049 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
AmfrQ9R049 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
AmfrQ9R049 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
AmfrQ9R049 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
AmfrQ9R049 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
AmfrQ9R049 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
AmfrQ9R049 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
AmfrQ9R049 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
AmfrQ9R049 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
AmfrQ9R049 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
AmfrQ9R049 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
AmfrQ9R049 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
AmfrQ9R049 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
AmfrQ9R049 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
AmfrQ9R049 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
AmfrQ9R049 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
AmfrQ9R049 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
AmfrQ9R049 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
AmfrQ9R049 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
AmfrQ9R049 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
AmfrQ9R049 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
AmfrQ9R049 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
AmfrQ9R049 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms