Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS2

Rnf4, E3 ubiquitin-protein ligase RNF4, mousemouse

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Length 194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf4Q9QZS2 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rnf4Q9QZS2 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rnf4Q9QZS2 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rnf4Q9QZS2 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rnf4Q9QZS2 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rnf4Q9QZS2 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rnf4Q9QZS2 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rnf4Q9QZS2 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rnf4Q9QZS2 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rnf4Q9QZS2 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rnf4Q9QZS2 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rnf4Q9QZS2 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rnf4Q9QZS2 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rnf4Q9QZS2 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rnf4Q9QZS2 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rnf4Q9QZS2 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Rnf4Q9QZS2 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf4Q9QZS2 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf4Q9QZS2 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf4Q9QZS2 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf4Q9QZS2 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf4Q9QZS2 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf4Q9QZS2 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf4Q9QZS2 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf4Q9QZS2 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf4Q9QZS2 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf4Q9QZS2 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf4Q9QZS2 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf4Q9QZS2 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf4Q9QZS2 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf4Q9QZS2 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf4Q9QZS2 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf4Q9QZS2 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf4Q9QZS2 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf4Q9QZS2 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf4Q9QZS2 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf4Q9QZS2 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf4Q9QZS2 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf4Q9QZS2 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf4Q9QZS2 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf4Q9QZS2 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf4Q9QZS2 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf4Q9QZS2 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf4Q9QZS2 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf4Q9QZS2 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf4Q9QZS2 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf4Q9QZS2 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf4Q9QZS2 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf4Q9QZS2 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf4Q9QZS2 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf4Q9QZS2 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf4Q9QZS2 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf4Q9QZS2 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf4Q9QZS2 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf4Q9QZS2 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf4Q9QZS2 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf4Q9QZS2 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf4Q9QZS2 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf4Q9QZS2 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf4Q9QZS2 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf4Q9QZS2 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf4Q9QZS2 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Rnf4Q9QZS2 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Rnf4Q9QZS2 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf4Q9QZS2 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf4Q9QZS2 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Rnf4Q9QZS2 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Rnf4Q9QZS2 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf4Q9QZS2 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf4Q9QZS2 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf4Q9QZS2 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf4Q9QZS2 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf4Q9QZS2 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf4Q9QZS2 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf4Q9QZS2 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf4Q9QZS2 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf4Q9QZS2 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf4Q9QZS2 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf4Q9QZS2 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf4Q9QZS2 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf4Q9QZS2 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf4Q9QZS2 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf4Q9QZS2 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf4Q9QZS2 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf4Q9QZS2 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf4Q9QZS2 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf4Q9QZS2 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf4Q9QZS2 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf4Q9QZS2 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf4Q9QZS2 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf4Q9QZS2 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf4Q9QZS2 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf4Q9QZS2 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf4Q9QZS2 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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