Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS0

Col4a3, Collagen alpha-3(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3Q9QZS0 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Col4a3Q9QZS0 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Col4a3Q9QZS0 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Col4a3Q9QZS0 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Col4a3Q9QZS0 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Col4a3Q9QZS0 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Col4a3Q9QZS0 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Col4a3Q9QZS0 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Col4a3Q9QZS0 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Col4a3Q9QZS0 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Col4a3Q9QZS0 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Col4a3Q9QZS0 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Col4a3Q9QZS0 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Col4a3Q9QZS0 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Col4a3Q9QZS0 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Col4a3Q9QZS0 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Col4a3Q9QZS0 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Col4a3Q9QZS0 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Col4a3Q9QZS0 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Col4a3Q9QZS0 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Col4a3Q9QZS0 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Col4a3Q9QZS0 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Col4a3Q9QZS0 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Col4a3Q9QZS0 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Col4a3Q9QZS0 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Col4a3Q9QZS0 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Col4a3Q9QZS0 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Col4a3Q9QZS0 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Col4a3Q9QZS0 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Col4a3Q9QZS0 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Col4a3Q9QZS0 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Col4a3Q9QZS0 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Col4a3Q9QZS0 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Col4a3Q9QZS0 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Col4a3Q9QZS0 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Col4a3Q9QZS0 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Col4a3Q9QZS0 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Col4a3Q9QZS0 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Col4a3Q9QZS0 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Col4a3Q9QZS0 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Col4a3Q9QZS0 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Col4a3Q9QZS0 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Col4a3Q9QZS0 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Col4a3Q9QZS0 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Col4a3Q9QZS0 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Col4a3Q9QZS0 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Col4a3Q9QZS0 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Col4a3Q9QZS0 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Col4a3Q9QZS0 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Col4a3Q9QZS0 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Col4a3Q9QZS0 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Col4a3Q9QZS0 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Col4a3Q9QZS0 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Col4a3Q9QZS0 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Col4a3Q9QZS0 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Col4a3Q9QZS0 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Col4a3Q9QZS0 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Col4a3Q9QZS0 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Col4a3Q9QZS0 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Col4a3Q9QZS0 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Col4a3Q9QZS0 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Col4a3Q9QZS0 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Col4a3Q9QZS0 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Col4a3Q9QZS0 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Col4a3Q9QZS0 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Col4a3Q9QZS0 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Col4a3Q9QZS0 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Col4a3Q9QZS0 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Col4a3Q9QZS0 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Col4a3Q9QZS0 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Col4a3Q9QZS0 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Col4a3Q9QZS0 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Col4a3Q9QZS0 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Col4a3Q9QZS0 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Col4a3Q9QZS0 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Col4a3Q9QZS0 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Col4a3Q9QZS0 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Col4a3Q9QZS0 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Col4a3Q9QZS0 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Col4a3Q9QZS0 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Col4a3Q9QZS0 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Col4a3Q9QZS0 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Col4a3Q9QZS0 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Col4a3Q9QZS0 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Col4a3Q9QZS0 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Col4a3Q9QZS0 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Col4a3Q9QZS0 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Col4a3Q9QZS0 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Col4a3Q9QZS0 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Col4a3Q9QZS0 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Col4a3Q9QZS0 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Col4a3Q9QZS0 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Col4a3Q9QZS0 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Col4a3Q9QZS0 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Col4a3Q9QZS0 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Col4a3Q9QZS0 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Col4a3Q9QZS0 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Col4a3Q9QZS0 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Col4a3Q9QZS0 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Col4a3Q9QZS0 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
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