Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZR9

Col4a4, Collagen alpha-4(IV) chain, mousemouse

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Length 1,682 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a4Q9QZR9 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
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Col4a4Q9QZR9 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Col4a4Q9QZR9 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Col4a4Q9QZR9 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Col4a4Q9QZR9 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
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Col4a4Q9QZR9 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Col4a4Q9QZR9 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Col4a4Q9QZR9 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Col4a4Q9QZR9 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Col4a4Q9QZR9 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Col4a4Q9QZR9 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Col4a4Q9QZR9 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Col4a4Q9QZR9 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Col4a4Q9QZR9 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Col4a4Q9QZR9 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Col4a4Q9QZR9 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Col4a4Q9QZR9 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Col4a4Q9QZR9 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Col4a4Q9QZR9 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Col4a4Q9QZR9 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Col4a4Q9QZR9 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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