Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD4

Ercc4, DNA repair endonuclease XPF, mousemouse

Predictions only

Length 917 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc4Q9QZD4 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ercc4Q9QZD4 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ercc4Q9QZD4 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ercc4Q9QZD4 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ercc4Q9QZD4 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ercc4Q9QZD4 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ercc4Q9QZD4 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ercc4Q9QZD4 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ercc4Q9QZD4 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ercc4Q9QZD4 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ercc4Q9QZD4 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ercc4Q9QZD4 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ercc4Q9QZD4 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ercc4Q9QZD4 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ercc4Q9QZD4 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ercc4Q9QZD4 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ercc4Q9QZD4 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ercc4Q9QZD4 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ercc4Q9QZD4 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ercc4Q9QZD4 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ercc4Q9QZD4 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ercc4Q9QZD4 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ercc4Q9QZD4 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ercc4Q9QZD4 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ercc4Q9QZD4 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ercc4Q9QZD4 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ercc4Q9QZD4 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ercc4Q9QZD4 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ercc4Q9QZD4 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ercc4Q9QZD4 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ercc4Q9QZD4 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ercc4Q9QZD4 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ercc4Q9QZD4 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ercc4Q9QZD4 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ercc4Q9QZD4 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ercc4Q9QZD4 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ercc4Q9QZD4 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ercc4Q9QZD4 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ercc4Q9QZD4 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ercc4Q9QZD4 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ercc4Q9QZD4 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ercc4Q9QZD4 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ercc4Q9QZD4 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ercc4Q9QZD4 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ercc4Q9QZD4 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ercc4Q9QZD4 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ercc4Q9QZD4 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ercc4Q9QZD4 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ercc4Q9QZD4 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ercc4Q9QZD4 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ercc4Q9QZD4 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ercc4Q9QZD4 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ercc4Q9QZD4 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ercc4Q9QZD4 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ercc4Q9QZD4 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ercc4Q9QZD4 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ercc4Q9QZD4 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ercc4Q9QZD4 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ercc4Q9QZD4 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ercc4Q9QZD4 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ercc4Q9QZD4 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ercc4Q9QZD4 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ercc4Q9QZD4 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ercc4Q9QZD4 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ercc4Q9QZD4 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ercc4Q9QZD4 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ercc4Q9QZD4 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ercc4Q9QZD4 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ercc4Q9QZD4 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ercc4Q9QZD4 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ercc4Q9QZD4 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ercc4Q9QZD4 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ercc4Q9QZD4 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ercc4Q9QZD4 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ercc4Q9QZD4 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ercc4Q9QZD4 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ercc4Q9QZD4 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ercc4Q9QZD4 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ercc4Q9QZD4 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ercc4Q9QZD4 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ercc4Q9QZD4 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ercc4Q9QZD4 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ercc4Q9QZD4 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ercc4Q9QZD4 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ercc4Q9QZD4 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ercc4Q9QZD4 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ercc4Q9QZD4 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ercc4Q9QZD4 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ercc4Q9QZD4 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ercc4Q9QZD4 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ercc4Q9QZD4 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ercc4Q9QZD4 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ercc4Q9QZD4 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ercc4Q9QZD4 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ercc4Q9QZD4 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ercc4Q9QZD4 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ercc4Q9QZD4 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ercc4Q9QZD4 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ercc4Q9QZD4 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ercc4Q9QZD4 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.2 ms