Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYF1

Rdh11, Retinol dehydrogenase 11, mousemouse

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Length 316 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh11Q9QYF1 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rdh11Q9QYF1 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rdh11Q9QYF1 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rdh11Q9QYF1 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rdh11Q9QYF1 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rdh11Q9QYF1 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rdh11Q9QYF1 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rdh11Q9QYF1 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rdh11Q9QYF1 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rdh11Q9QYF1 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rdh11Q9QYF1 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rdh11Q9QYF1 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Rdh11Q9QYF1 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rdh11Q9QYF1 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rdh11Q9QYF1 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rdh11Q9QYF1 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rdh11Q9QYF1 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rdh11Q9QYF1 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rdh11Q9QYF1 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rdh11Q9QYF1 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rdh11Q9QYF1 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rdh11Q9QYF1 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rdh11Q9QYF1 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rdh11Q9QYF1 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rdh11Q9QYF1 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Rdh11Q9QYF1 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rdh11Q9QYF1 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rdh11Q9QYF1 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rdh11Q9QYF1 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rdh11Q9QYF1 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rdh11Q9QYF1 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rdh11Q9QYF1 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rdh11Q9QYF1 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rdh11Q9QYF1 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rdh11Q9QYF1 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rdh11Q9QYF1 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rdh11Q9QYF1 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rdh11Q9QYF1 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rdh11Q9QYF1 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rdh11Q9QYF1 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rdh11Q9QYF1 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rdh11Q9QYF1 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rdh11Q9QYF1 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rdh11Q9QYF1 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rdh11Q9QYF1 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rdh11Q9QYF1 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rdh11Q9QYF1 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rdh11Q9QYF1 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rdh11Q9QYF1 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rdh11Q9QYF1 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rdh11Q9QYF1 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Rdh11Q9QYF1 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rdh11Q9QYF1 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rdh11Q9QYF1 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rdh11Q9QYF1 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rdh11Q9QYF1 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rdh11Q9QYF1 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rdh11Q9QYF1 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rdh11Q9QYF1 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rdh11Q9QYF1 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rdh11Q9QYF1 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rdh11Q9QYF1 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Rdh11Q9QYF1 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
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Rdh11Q9QYF1 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rdh11Q9QYF1 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rdh11Q9QYF1 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rdh11Q9QYF1 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rdh11Q9QYF1 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rdh11Q9QYF1 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rdh11Q9QYF1 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rdh11Q9QYF1 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rdh11Q9QYF1 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rdh11Q9QYF1 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rdh11Q9QYF1 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rdh11Q9QYF1 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rdh11Q9QYF1 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rdh11Q9QYF1 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rdh11Q9QYF1 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rdh11Q9QYF1 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rdh11Q9QYF1 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rdh11Q9QYF1 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rdh11Q9QYF1 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rdh11Q9QYF1 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rdh11Q9QYF1 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rdh11Q9QYF1 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rdh11Q9QYF1 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rdh11Q9QYF1 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Rdh11Q9QYF1 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rdh11Q9QYF1 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rdh11Q9QYF1 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rdh11Q9QYF1 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rdh11Q9QYF1 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rdh11Q9QYF1 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rdh11Q9QYF1 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rdh11Q9QYF1 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Rdh11Q9QYF1 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rdh11Q9QYF1 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
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