Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY76

Vapb, Vesicle-associated membrane protein-associated protein B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VapbQ9QY76 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
VapbQ9QY76 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
VapbQ9QY76 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
VapbQ9QY76 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
VapbQ9QY76 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
VapbQ9QY76 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
VapbQ9QY76 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
VapbQ9QY76 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
VapbQ9QY76 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
VapbQ9QY76 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
VapbQ9QY76 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
VapbQ9QY76 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
VapbQ9QY76 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
VapbQ9QY76 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
VapbQ9QY76 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
VapbQ9QY76 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
VapbQ9QY76 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
VapbQ9QY76 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
VapbQ9QY76 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
VapbQ9QY76 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
VapbQ9QY76 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
VapbQ9QY76 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
VapbQ9QY76 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
VapbQ9QY76 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
VapbQ9QY76 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
VapbQ9QY76 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
VapbQ9QY76 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
VapbQ9QY76 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
VapbQ9QY76 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
VapbQ9QY76 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
VapbQ9QY76 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
VapbQ9QY76 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
VapbQ9QY76 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
VapbQ9QY76 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
VapbQ9QY76 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
VapbQ9QY76 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
VapbQ9QY76 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
VapbQ9QY76 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
VapbQ9QY76 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
VapbQ9QY76 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
VapbQ9QY76 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
VapbQ9QY76 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
VapbQ9QY76 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
VapbQ9QY76 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
VapbQ9QY76 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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VapbQ9QY76 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
VapbQ9QY76 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
VapbQ9QY76 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
VapbQ9QY76 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
VapbQ9QY76 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
VapbQ9QY76 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
VapbQ9QY76 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
VapbQ9QY76 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
VapbQ9QY76 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
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VapbQ9QY76 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
VapbQ9QY76 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
VapbQ9QY76 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
VapbQ9QY76 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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VapbQ9QY76 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
VapbQ9QY76 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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VapbQ9QY76 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
VapbQ9QY76 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
VapbQ9QY76 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
VapbQ9QY76 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
VapbQ9QY76 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
VapbQ9QY76 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
VapbQ9QY76 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
VapbQ9QY76 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
VapbQ9QY76 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
VapbQ9QY76 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
VapbQ9QY76 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
VapbQ9QY76 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
VapbQ9QY76 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
VapbQ9QY76 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
VapbQ9QY76 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
VapbQ9QY76 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
VapbQ9QY76 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
VapbQ9QY76 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
VapbQ9QY76 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
VapbQ9QY76 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
VapbQ9QY76 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
VapbQ9QY76 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
VapbQ9QY76 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
VapbQ9QY76 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
VapbQ9QY76 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
VapbQ9QY76 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
VapbQ9QY76 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
VapbQ9QY76 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
VapbQ9QY76 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
VapbQ9QY76 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
VapbQ9QY76 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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