Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXZ7

Nr2e3, Photoreceptor-specific nuclear receptor, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2e3Q9QXZ7 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nr2e3Q9QXZ7 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nr2e3Q9QXZ7 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nr2e3Q9QXZ7 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nr2e3Q9QXZ7 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nr2e3Q9QXZ7 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nr2e3Q9QXZ7 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nr2e3Q9QXZ7 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nr2e3Q9QXZ7 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nr2e3Q9QXZ7 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Nr2e3Q9QXZ7 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Nr2e3Q9QXZ7 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nr2e3Q9QXZ7 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Nr2e3Q9QXZ7 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Nr2e3Q9QXZ7 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nr2e3Q9QXZ7 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nr2e3Q9QXZ7 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nr2e3Q9QXZ7 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nr2e3Q9QXZ7 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nr2e3Q9QXZ7 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nr2e3Q9QXZ7 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nr2e3Q9QXZ7 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nr2e3Q9QXZ7 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nr2e3Q9QXZ7 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nr2e3Q9QXZ7 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nr2e3Q9QXZ7 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nr2e3Q9QXZ7 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nr2e3Q9QXZ7 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nr2e3Q9QXZ7 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nr2e3Q9QXZ7 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nr2e3Q9QXZ7 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nr2e3Q9QXZ7 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nr2e3Q9QXZ7 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Nr2e3Q9QXZ7 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nr2e3Q9QXZ7 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nr2e3Q9QXZ7 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nr2e3Q9QXZ7 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nr2e3Q9QXZ7 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nr2e3Q9QXZ7 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nr2e3Q9QXZ7 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nr2e3Q9QXZ7 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nr2e3Q9QXZ7 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nr2e3Q9QXZ7 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Nr2e3Q9QXZ7 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nr2e3Q9QXZ7 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nr2e3Q9QXZ7 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nr2e3Q9QXZ7 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nr2e3Q9QXZ7 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Nr2e3Q9QXZ7 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nr2e3Q9QXZ7 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nr2e3Q9QXZ7 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nr2e3Q9QXZ7 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nr2e3Q9QXZ7 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nr2e3Q9QXZ7 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nr2e3Q9QXZ7 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nr2e3Q9QXZ7 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nr2e3Q9QXZ7 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nr2e3Q9QXZ7 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nr2e3Q9QXZ7 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nr2e3Q9QXZ7 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nr2e3Q9QXZ7 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nr2e3Q9QXZ7 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nr2e3Q9QXZ7 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nr2e3Q9QXZ7 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nr2e3Q9QXZ7 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nr2e3Q9QXZ7 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nr2e3Q9QXZ7 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nr2e3Q9QXZ7 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Nr2e3Q9QXZ7 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nr2e3Q9QXZ7 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Nr2e3Q9QXZ7 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nr2e3Q9QXZ7 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Nr2e3Q9QXZ7 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Nr2e3Q9QXZ7 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nr2e3Q9QXZ7 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nr2e3Q9QXZ7 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nr2e3Q9QXZ7 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nr2e3Q9QXZ7 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nr2e3Q9QXZ7 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nr2e3Q9QXZ7 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nr2e3Q9QXZ7 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nr2e3Q9QXZ7 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nr2e3Q9QXZ7 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nr2e3Q9QXZ7 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nr2e3Q9QXZ7 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nr2e3Q9QXZ7 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nr2e3Q9QXZ7 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nr2e3Q9QXZ7 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nr2e3Q9QXZ7 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nr2e3Q9QXZ7 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nr2e3Q9QXZ7 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nr2e3Q9QXZ7 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nr2e3Q9QXZ7 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nr2e3Q9QXZ7 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nr2e3Q9QXZ7 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nr2e3Q9QXZ7 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nr2e3Q9QXZ7 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Nr2e3Q9QXZ7 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nr2e3Q9QXZ7 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Nr2e3Q9QXZ7 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.8 ms