Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXT8

Kcnip3, Calsenilin, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnip3Q9QXT8 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Kcnip3Q9QXT8 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Kcnip3Q9QXT8 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Kcnip3Q9QXT8 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Kcnip3Q9QXT8 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Kcnip3Q9QXT8 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Kcnip3Q9QXT8 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Kcnip3Q9QXT8 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Kcnip3Q9QXT8 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Kcnip3Q9QXT8 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Kcnip3Q9QXT8 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Kcnip3Q9QXT8 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Kcnip3Q9QXT8 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Kcnip3Q9QXT8 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Kcnip3Q9QXT8 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Kcnip3Q9QXT8 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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Kcnip3Q9QXT8 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Kcnip3Q9QXT8 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Kcnip3Q9QXT8 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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Kcnip3Q9QXT8 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Kcnip3Q9QXT8 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Kcnip3Q9QXT8 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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Kcnip3Q9QXT8 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
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Kcnip3Q9QXT8 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Kcnip3Q9QXT8 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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Kcnip3Q9QXT8 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Kcnip3Q9QXT8 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Kcnip3Q9QXT8 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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Kcnip3Q9QXT8 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Kcnip3Q9QXT8 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Kcnip3Q9QXT8 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Kcnip3Q9QXT8 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Kcnip3Q9QXT8 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Kcnip3Q9QXT8 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Kcnip3Q9QXT8 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Kcnip3Q9QXT8 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Kcnip3Q9QXT8 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Kcnip3Q9QXT8 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Kcnip3Q9QXT8 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Kcnip3Q9QXT8 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Kcnip3Q9QXT8 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Kcnip3Q9QXT8 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Kcnip3Q9QXT8 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Kcnip3Q9QXT8 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Kcnip3Q9QXT8 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Kcnip3Q9QXT8 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Kcnip3Q9QXT8 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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