Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA7

Trim44, Tripartite motif-containing protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim44Q9QXA7 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim44Q9QXA7 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim44Q9QXA7 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim44Q9QXA7 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim44Q9QXA7 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim44Q9QXA7 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim44Q9QXA7 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim44Q9QXA7 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim44Q9QXA7 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim44Q9QXA7 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim44Q9QXA7 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim44Q9QXA7 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim44Q9QXA7 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim44Q9QXA7 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim44Q9QXA7 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim44Q9QXA7 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim44Q9QXA7 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim44Q9QXA7 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim44Q9QXA7 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim44Q9QXA7 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim44Q9QXA7 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim44Q9QXA7 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim44Q9QXA7 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim44Q9QXA7 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim44Q9QXA7 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim44Q9QXA7 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim44Q9QXA7 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim44Q9QXA7 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim44Q9QXA7 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim44Q9QXA7 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim44Q9QXA7 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim44Q9QXA7 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim44Q9QXA7 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim44Q9QXA7 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim44Q9QXA7 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim44Q9QXA7 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trim44Q9QXA7 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trim44Q9QXA7 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trim44Q9QXA7 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trim44Q9QXA7 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trim44Q9QXA7 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trim44Q9QXA7 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim44Q9QXA7 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim44Q9QXA7 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim44Q9QXA7 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim44Q9QXA7 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim44Q9QXA7 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim44Q9QXA7 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim44Q9QXA7 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim44Q9QXA7 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim44Q9QXA7 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim44Q9QXA7 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim44Q9QXA7 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim44Q9QXA7 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim44Q9QXA7 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim44Q9QXA7 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim44Q9QXA7 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim44Q9QXA7 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim44Q9QXA7 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim44Q9QXA7 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim44Q9QXA7 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim44Q9QXA7 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim44Q9QXA7 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim44Q9QXA7 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim44Q9QXA7 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim44Q9QXA7 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim44Q9QXA7 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim44Q9QXA7 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim44Q9QXA7 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim44Q9QXA7 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim44Q9QXA7 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim44Q9QXA7 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim44Q9QXA7 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim44Q9QXA7 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim44Q9QXA7 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim44Q9QXA7 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim44Q9QXA7 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim44Q9QXA7 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim44Q9QXA7 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim44Q9QXA7 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim44Q9QXA7 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim44Q9QXA7 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim44Q9QXA7 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim44Q9QXA7 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim44Q9QXA7 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim44Q9QXA7 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim44Q9QXA7 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim44Q9QXA7 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim44Q9QXA7 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim44Q9QXA7 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim44Q9QXA7 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim44Q9QXA7 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim44Q9QXA7 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim44Q9QXA7 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim44Q9QXA7 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim44Q9QXA7 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim44Q9QXA7 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim44Q9QXA7 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim44Q9QXA7 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim44Q9QXA7 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms