Protein–RNA interactions for Protein: Q9QW08

Pdc, Phosducin, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdcQ9QW08 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PdcQ9QW08 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PdcQ9QW08 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PdcQ9QW08 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PdcQ9QW08 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PdcQ9QW08 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PdcQ9QW08 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PdcQ9QW08 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PdcQ9QW08 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PdcQ9QW08 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PdcQ9QW08 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PdcQ9QW08 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PdcQ9QW08 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PdcQ9QW08 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PdcQ9QW08 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PdcQ9QW08 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PdcQ9QW08 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PdcQ9QW08 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PdcQ9QW08 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PdcQ9QW08 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PdcQ9QW08 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PdcQ9QW08 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PdcQ9QW08 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PdcQ9QW08 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PdcQ9QW08 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PdcQ9QW08 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PdcQ9QW08 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PdcQ9QW08 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PdcQ9QW08 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PdcQ9QW08 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PdcQ9QW08 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PdcQ9QW08 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PdcQ9QW08 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PdcQ9QW08 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PdcQ9QW08 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PdcQ9QW08 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PdcQ9QW08 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PdcQ9QW08 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PdcQ9QW08 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PdcQ9QW08 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PdcQ9QW08 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PdcQ9QW08 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PdcQ9QW08 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PdcQ9QW08 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PdcQ9QW08 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PdcQ9QW08 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PdcQ9QW08 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PdcQ9QW08 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PdcQ9QW08 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PdcQ9QW08 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PdcQ9QW08 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PdcQ9QW08 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PdcQ9QW08 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PdcQ9QW08 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PdcQ9QW08 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PdcQ9QW08 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PdcQ9QW08 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PdcQ9QW08 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PdcQ9QW08 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PdcQ9QW08 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PdcQ9QW08 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PdcQ9QW08 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PdcQ9QW08 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PdcQ9QW08 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PdcQ9QW08 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PdcQ9QW08 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PdcQ9QW08 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PdcQ9QW08 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PdcQ9QW08 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PdcQ9QW08 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PdcQ9QW08 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PdcQ9QW08 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PdcQ9QW08 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PdcQ9QW08 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PdcQ9QW08 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PdcQ9QW08 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PdcQ9QW08 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PdcQ9QW08 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PdcQ9QW08 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PdcQ9QW08 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PdcQ9QW08 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PdcQ9QW08 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PdcQ9QW08 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PdcQ9QW08 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PdcQ9QW08 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PdcQ9QW08 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PdcQ9QW08 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PdcQ9QW08 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PdcQ9QW08 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PdcQ9QW08 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PdcQ9QW08 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PdcQ9QW08 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PdcQ9QW08 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PdcQ9QW08 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PdcQ9QW08 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PdcQ9QW08 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PdcQ9QW08 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PdcQ9QW08 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PdcQ9QW08 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PdcQ9QW08 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms