Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME7

Trappc2l, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc2lQ9JME7 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trappc2lQ9JME7 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trappc2lQ9JME7 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trappc2lQ9JME7 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Trappc2lQ9JME7 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trappc2lQ9JME7 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trappc2lQ9JME7 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trappc2lQ9JME7 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trappc2lQ9JME7 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trappc2lQ9JME7 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trappc2lQ9JME7 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trappc2lQ9JME7 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trappc2lQ9JME7 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trappc2lQ9JME7 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trappc2lQ9JME7 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Trappc2lQ9JME7 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trappc2lQ9JME7 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trappc2lQ9JME7 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trappc2lQ9JME7 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trappc2lQ9JME7 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trappc2lQ9JME7 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trappc2lQ9JME7 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Trappc2lQ9JME7 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Trappc2lQ9JME7 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Trappc2lQ9JME7 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Trappc2lQ9JME7 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Trappc2lQ9JME7 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trappc2lQ9JME7 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trappc2lQ9JME7 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trappc2lQ9JME7 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trappc2lQ9JME7 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trappc2lQ9JME7 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trappc2lQ9JME7 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trappc2lQ9JME7 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trappc2lQ9JME7 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trappc2lQ9JME7 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trappc2lQ9JME7 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trappc2lQ9JME7 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trappc2lQ9JME7 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trappc2lQ9JME7 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trappc2lQ9JME7 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trappc2lQ9JME7 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trappc2lQ9JME7 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Trappc2lQ9JME7 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Trappc2lQ9JME7 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Trappc2lQ9JME7 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Trappc2lQ9JME7 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Trappc2lQ9JME7 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Trappc2lQ9JME7 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Trappc2lQ9JME7 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Trappc2lQ9JME7 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Trappc2lQ9JME7 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Trappc2lQ9JME7 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Trappc2lQ9JME7 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Trappc2lQ9JME7 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Trappc2lQ9JME7 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Trappc2lQ9JME7 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Trappc2lQ9JME7 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Trappc2lQ9JME7 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Trappc2lQ9JME7 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Trappc2lQ9JME7 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Trappc2lQ9JME7 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Trappc2lQ9JME7 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Trappc2lQ9JME7 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Trappc2lQ9JME7 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Trappc2lQ9JME7 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Trappc2lQ9JME7 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Trappc2lQ9JME7 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Trappc2lQ9JME7 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Trappc2lQ9JME7 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Trappc2lQ9JME7 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Trappc2lQ9JME7 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Trappc2lQ9JME7 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Trappc2lQ9JME7 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Trappc2lQ9JME7 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Trappc2lQ9JME7 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Trappc2lQ9JME7 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Trappc2lQ9JME7 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Trappc2lQ9JME7 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Trappc2lQ9JME7 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Trappc2lQ9JME7 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Trappc2lQ9JME7 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Trappc2lQ9JME7 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Trappc2lQ9JME7 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Trappc2lQ9JME7 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Trappc2lQ9JME7 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Trappc2lQ9JME7 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Trappc2lQ9JME7 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Trappc2lQ9JME7 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Trappc2lQ9JME7 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Trappc2lQ9JME7 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Trappc2lQ9JME7 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Trappc2lQ9JME7 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Trappc2lQ9JME7 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Trappc2lQ9JME7 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Trappc2lQ9JME7 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Trappc2lQ9JME7 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Trappc2lQ9JME7 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Trappc2lQ9JME7 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Trappc2lQ9JME7 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms