Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMD1

Sfmbt1, Scm-like with four MBT domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt1Q9JMD1 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sfmbt1Q9JMD1 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sfmbt1Q9JMD1 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Sfmbt1Q9JMD1 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Sfmbt1Q9JMD1 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Sfmbt1Q9JMD1 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Sfmbt1Q9JMD1 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.6 ms