Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL95

Prg3, Proteoglycan 3, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prg3Q9JL95 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prg3Q9JL95 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prg3Q9JL95 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Prg3Q9JL95 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prg3Q9JL95 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prg3Q9JL95 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Prg3Q9JL95 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prg3Q9JL95 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prg3Q9JL95 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prg3Q9JL95 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prg3Q9JL95 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prg3Q9JL95 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prg3Q9JL95 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prg3Q9JL95 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Prg3Q9JL95 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Prg3Q9JL95 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prg3Q9JL95 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Prg3Q9JL95 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prg3Q9JL95 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Prg3Q9JL95 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prg3Q9JL95 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prg3Q9JL95 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prg3Q9JL95 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prg3Q9JL95 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prg3Q9JL95 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prg3Q9JL95 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prg3Q9JL95 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prg3Q9JL95 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prg3Q9JL95 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prg3Q9JL95 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prg3Q9JL95 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prg3Q9JL95 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prg3Q9JL95 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prg3Q9JL95 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prg3Q9JL95 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prg3Q9JL95 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prg3Q9JL95 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prg3Q9JL95 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prg3Q9JL95 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prg3Q9JL95 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prg3Q9JL95 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prg3Q9JL95 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Prg3Q9JL95 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Prg3Q9JL95 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prg3Q9JL95 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prg3Q9JL95 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prg3Q9JL95 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prg3Q9JL95 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prg3Q9JL95 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prg3Q9JL95 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prg3Q9JL95 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prg3Q9JL95 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prg3Q9JL95 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prg3Q9JL95 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prg3Q9JL95 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prg3Q9JL95 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prg3Q9JL95 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prg3Q9JL95 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prg3Q9JL95 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prg3Q9JL95 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prg3Q9JL95 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prg3Q9JL95 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prg3Q9JL95 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prg3Q9JL95 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prg3Q9JL95 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prg3Q9JL95 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prg3Q9JL95 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prg3Q9JL95 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Prg3Q9JL95 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prg3Q9JL95 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prg3Q9JL95 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prg3Q9JL95 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prg3Q9JL95 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prg3Q9JL95 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prg3Q9JL95 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prg3Q9JL95 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prg3Q9JL95 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prg3Q9JL95 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prg3Q9JL95 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prg3Q9JL95 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prg3Q9JL95 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prg3Q9JL95 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prg3Q9JL95 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prg3Q9JL95 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Prg3Q9JL95 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prg3Q9JL95 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prg3Q9JL95 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Prg3Q9JL95 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Prg3Q9JL95 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prg3Q9JL95 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Prg3Q9JL95 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prg3Q9JL95 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prg3Q9JL95 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prg3Q9JL95 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prg3Q9JL95 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prg3Q9JL95 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.6 ms